RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589216.1

PTPN2-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 2, human

TSL 3

Gene PTPN2, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN2-208	ENST00000589216	MYLK3	Q32MK0	819 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	BOLA3	Q53S33	107 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	FAM71B	Q8TC56	605 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	RFFL	Q8WZ73	363 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	SERAC1	Q96JX3	654 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	GAREM1	Q9H706	876 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	SP110	Q9HB58	689 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	PREB	Q9HCU5	417 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	LRP4	O75096	1905 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	SPEG	Q15772	3267 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	VILL	O15195	856 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	RAD51B	O15315	384 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	SLC31A1	O15431	190 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	OPHN1	O60890	802 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	SYP	P08247	313 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	FECH	P22830	423 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	SNRPD1	P62314	119 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	KRT81	Q14533	505 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	SHB	Q15464	509 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	HORMAD1	Q86X24	394 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	NAXD	Q8IW45	347 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	PLPP6	Q8IY26	295 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	PQLC3	Q8N755	202 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	TMEM145	Q8NBT3	493 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	RAPGEF5	Q92565	580 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	CALN1	Q9BXU9	219 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	DYRK4	Q9NR20	520 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	TSPAN11	A1L157	253 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	RCCD1	A6NED2	376 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	AREL1	O15033	823 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	SH3BP5	O60239	455 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	MAFK	O60675	156 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	PCDH8	O95206	1070 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	LCA5L	O95447	670 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	CER1	O95813	267 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	PRKCG	P05129	697 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	ADRB1	P08588	477 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	CSRP1	P21291	193 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	CD38	P28907	300 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	MARCKSL1	P49006	195 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	CLDN2	P57739	230 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	NXPH1	P58417	271 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	SEMG2	Q02383	582 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	GBE1	Q04446	702 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	IL10RB	Q08334	325 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	TEAD4	Q15561	434 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	TMEM139	Q8IV31	216 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	PGBD5	Q8N414	524 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	FAF2	Q96CS3	445 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	ZNF670	Q9BS34	389 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PTPN2-208	ENST00000589216	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54 ms