RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
CAPNS1-206ENST00000588815 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
CAPNS1-206ENST00000588815 TIMM44O43615 452 aa31.4■■■□□ 2.62
CAPNS1-206ENST00000588815 AGTP01019 485 aa31.4■■■□□ 2.62
CAPNS1-206ENST00000588815 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
CAPNS1-206ENST00000588815 HLA-DPA1P20036 260 aa31.4■■■□□ 2.62
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNA5P22460 613 aa31.4■■■□□ 2.62
CAPNS1-206ENST00000588815 NNMTP40261 264 aa31.4■■■□□ 2.62
CAPNS1-206ENST00000588815 RGRP47804 291 aa31.4■■■□□ 2.62
CAPNS1-206ENST00000588815 IFFO1Q0D2I5 559 aa31.4■■■□□ 2.62
CAPNS1-206ENST00000588815 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
CAPNS1-206ENST00000588815 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP31.4■■■□□ 2.62
CAPNS1-206ENST00000588815 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP31.4■■■□□ 2.62
CAPNS1-206ENST00000588815 PLCD3Q8N3E9 789 aa31.4■■■□□ 2.62
CAPNS1-206ENST00000588815 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
CAPNS1-206ENST00000588815 NXPE3Q969Y0 559 aa31.4■■■□□ 2.62
CAPNS1-206ENST00000588815 IFT43Q96FT9 208 aa31.4■■■□□ 2.62
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM109Q9BVC6 243 aa31.4■■■□□ 2.62
CAPNS1-206ENST00000588815 VPS37BQ9H9H4 285 aa31.4■■■□□ 2.62
CAPNS1-206ENST00000588815 NOD2Q9HC29 1040 aa31.4■■■□□ 2.62
CAPNS1-206ENST00000588815 SAMD15Q9P1V8 674 aa31.4■■■□□ 2.62
CAPNS1-206ENST00000588815 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
CAPNS1-206ENST00000588815 NUMBLQ9Y6R0 609 aa31.4■■■□□ 2.62
CAPNS1-206ENST00000588815 OPA1O60313 960 aa31.39■■■□□ 2.62
CAPNS1-206ENST00000588815 IGSF6O95976 241 aa31.39■■■□□ 2.62
CAPNS1-206ENST00000588815 MGAT1P26572 445 aa31.39■■■□□ 2.62
CAPNS1-206ENST00000588815 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP31.39■■■□□ 2.62
CAPNS1-206ENST00000588815 CDK18Q07002 472 aa31.39■■■□□ 2.62
CAPNS1-206ENST00000588815 STAT4Q14765 748 aa31.39■■■□□ 2.62
CAPNS1-206ENST00000588815 PCSK7Q16549 785 aa31.39■■■□□ 2.62
CAPNS1-206ENST00000588815 GEN1Q17RS7 908 aa31.39■■■□□ 2.62
CAPNS1-206ENST00000588815 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa31.39■■■□□ 2.62
CAPNS1-206ENST00000588815 DENND5AQ6IQ26 1287 aa31.39■■■□□ 2.62
CAPNS1-206ENST00000588815 SRLQ86TD4 932 aa31.39■■■□□ 2.62
CAPNS1-206ENST00000588815 C12orf40Q86WS4 652 aa31.39■■■□□ 2.62
CAPNS1-206ENST00000588815 PLPP6Q8IY26 295 aa31.39■■■□□ 2.62
CAPNS1-206ENST00000588815 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP31.39■■■□□ 2.62
CAPNS1-206ENST00000588815 PPCSQ9HAB8 311 aa31.39■■■□□ 2.62
CAPNS1-206ENST00000588815 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP31.39■■■□□ 2.62
CAPNS1-206ENST00000588815 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa31.39■■■□□ 2.62
CAPNS1-206ENST00000588815 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP31.38■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP31.38■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 GSRP00390 522 aa31.38■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 MTM1Q13496 603 aa31.38■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 OLIG2Q13516 323 aa31.38■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC1A5Q15758 541 aa31.38■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 NCEH1Q6PIU2 408 aa31.38■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa31.38■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 IGDCC3Q8IVU1 814 aa31.38■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP31.38■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 EXOC2Q96KP1 924 aa31.38■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC8A2Q9UPR5 921 aa31.38■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 ERVW-1Q9UQF0 538 aa31.38■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP31.37■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 FGF1P05230 155 aa31.37■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 PGAM1P18669 254 aa31.37■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 GJA4P35212 333 aa31.37■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP31.37■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 GPX6P59796 221 aa31.37■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 IHHQ14623 411 aa31.37■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM215Q68D42 235 aa31.37■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 CASC4Q6P4E1 433 aa31.37■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 C22orf39Q6P5X5 142 aa31.37■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 OR2AP1Q8NGE2 309 aa31.37■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP31.37■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 APOL2Q9BQE5 337 aa31.37■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 K7ERQ8 282 aa31.36■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 AGPSO00116 658 aa31.36■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 ARNTLO00327 626 aa31.36■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 ATP9BO43861 1147 aa31.36■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 TCEA3O75764 348 aa31.36■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 IVLP07476 585 aa31.36■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 DLDP09622 509 aaKnown RBP31.36■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 FOSL2P15408 326 aa31.36■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP31.36■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 STEAP4Q687X5 459 aa31.36■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 CYS1Q717R9 158 aa31.36■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 MPP5Q8N3R9 675 aa31.36■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 KDM1BQ8NB78 822 aa31.36■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP31.36■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 BRD9Q9H8M2 597 aa31.36■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 MED4Q9NPJ6 270 aa31.36■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 SYBUQ9NX95 663 aa31.36■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP31.36■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP31.35■■■□□ 2.61
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CAPNS1-206ENST00000588815 GRM3Q14832 879 aa31.35■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP31.35■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 NUDT18Q6ZVK8 323 aa31.35■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP31.35■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 HLA-CQ95604 372 aa31.35■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP31.35■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP31.35■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 GTSE1Q9NYZ3 720 aa31.35■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 FETUBQ9UGM5 382 aa31.35■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 SZT2Q5T011 3432 aa31.35■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 C5orf42Q9H799 3197 aa31.35■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa31.34■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 TRIM24O15164 1050 aa31.34■■■□□ 2.61
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