RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP33.53■■■□□ 2.96
CTDNEP1-209ENST00000574205 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP33.53■■■□□ 2.96
CTDNEP1-209ENST00000574205 NUDCD1Q96RS6 583 aa33.53■■■□□ 2.96
CTDNEP1-209ENST00000574205 IL12RB2Q99665 862 aa33.53■■■□□ 2.96
CTDNEP1-209ENST00000574205 SGK2Q9HBY8 427 aa33.53■■■□□ 2.96
CTDNEP1-209ENST00000574205 ANKRD36A6QL64 1941 aa33.52■■■□□ 2.96
CTDNEP1-209ENST00000574205 MTSS1O43312 755 aa33.52■■■□□ 2.96
CTDNEP1-209ENST00000574205 JCHAINP01591 159 aa33.52■■■□□ 2.96
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLK5Q496M5 336 aa33.52■■■□□ 2.96
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF805Q5CZA5 627 aa33.52■■■□□ 2.96
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRR23BQ6ZRT6 265 aa33.52■■■□□ 2.96
CTDNEP1-209ENST00000574205 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa33.52■■■□□ 2.96
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP33.52■■■□□ 2.96
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARRDC3Q96B67 414 aa33.52■■■□□ 2.96
CTDNEP1-209ENST00000574205 THADAQ6YHU6 1953 aa33.51■■■□□ 2.96
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC7A4O43246 635 aa33.51■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 NDUFS2O75306 463 aa33.51■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACSL1P33121 698 aa33.51■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP33.51■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 CNTN1Q12860 1018 aa33.51■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZBTB17Q13105 803 aa33.51■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC45A4Q5BKX6 768 aa33.51■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 ALG1LQ6GMV1 187 aa33.51■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 HDAC8Q9BY41 377 aa33.51■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa33.51■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 SCUBE2Q9NQ36 999 aa33.51■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 H7C0C1 242 aa33.5■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 HLA-DQB2P05538 268 aa33.5■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 CXCR5P32302 372 aa33.5■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATP5OP48047 213 aa33.5■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP33.5■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 ITKQ08881 620 aa33.5■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 ELF2Q15723 593 aa33.5■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPDYCQ5MJ68 293 aa33.5■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP33.5■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP33.5■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP33.5■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 KLHL32Q96NJ5 620 aa33.5■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP33.5■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 SEPT10Q9P0V9 454 aa33.5■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa33.5■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 TTLL3Q9Y4R7 772 aa33.5■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 CEP192Q8TEP8 1941 aa33.5■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa33.49■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 GJB3O75712 270 aa33.49■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 SERPINA4P29622 427 aa33.49■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 AGBL4Q5VU57 503 aa33.49■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 PMS2CLQ68D20 193 aa33.49■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 LPCAT2Q7L5N7 544 aa33.49■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 SUV39H2Q9H5I1 410 aa33.49■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAB23Q9ULC3 237 aa33.49■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP33.48■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLK4O00444 970 aa33.48■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 PIGNO95427 931 aa33.48■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP33.48■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 RBP3P10745 1247 aa33.48■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 CES1P23141 567 aa33.48■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 NEK3P51956 506 aa33.48■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 GNG11P61952 73 aa33.48■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 TEX44Q53QW1 395 aa33.48■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa33.48■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 NCEH1Q6PIU2 408 aa33.48■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 HTR3CQ8WXA8 447 aa33.48■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 SEMA3CQ99985 751 aa33.48■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM118BQ9BPY3 351 aa33.48■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPR174Q9BXC1 333 aa33.48■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 NOD2Q9HC29 1040 aa33.48■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 SDK1Q7Z5N4 2213 aa33.48■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 PROB1E7EW31 1015 aa33.48■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 RHOBTB1O94844 696 aa33.48■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 SEMA4FO95754 770 aa33.48■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADPRHP54922 357 aa33.48■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 BCL2L1Q07817 233 aa33.48■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP33.48■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 CAMK1DQ8IU85 385 aa33.48■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP33.48■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 CNTD1Q8N815 330 aa33.48■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 HCAR2Q8TDS4 363 aa33.48■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 FERMT1Q9BQL6 677 aa33.48■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 DKK3Q9UBP4 350 aa33.48■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP33.48■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa33.47■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP33.47■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 C16orf96A6NNT2 1141 aa33.47■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 PTPN3P26045 913 aa33.47■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 HS1BP3Q53T59 392 aa33.47■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 FBXL19Q6PCT2 694 aa33.47■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEFF1Q8IYR6 380 aa33.47■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 SUMF1Q8NBK3 374 aa33.47■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 CADM4Q8NFZ8 388 aa33.47■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR14C36Q8NHC7 312 aa33.47■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 PBKQ96KB5 322 aa33.47■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 VAT1Q99536 393 aa33.47■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 CEP41Q9BYV8 373 aa33.47■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 PCED1AQ9H1Q7 454 aa33.47■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 KDM4CQ9H3R0 1056 aa33.47■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP33.47■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP33.46■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 CEP104O60308 925 aa33.46■■■□□ 2.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP33.46■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms