RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557295.1

LINC00640-204, long intergenic non-protein coding RNA 640, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LINC00640, Length 708 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00640-204ENST00000557295 ITGA11Q9UKX5 1188 aa7.08□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa7.08□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 SNX9Q9Y5X1 595 aa7.08□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 TEX15Q9BXT5 2789 aa7.08□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 MGAQ8IWI9 3026 aa7.07□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa7.07□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa7.07□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 A0A1B0GTQ1 180 aa7.07□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa7.07□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 F8VP50 259 aa7.07□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 K7ENM7 598 aa7.07□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 PRKD3O94806 890 aa7.07□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 APOL3O95236 402 aa7.07□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 PLA2G4BP0C869 781 aa7.07□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 MYBL2P10244 700 aa7.07□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 TYRP14679 529 aa7.07□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 ACO1P21399 889 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 LMO2P25791 158 aa7.07□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 CD27P26842 260 aa7.07□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 YWHAQP27348 245 aa7.07□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 ADSSP30520 456 aa7.07□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 PRPHP41219 470 aa7.07□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 COPAP53621 1224 aa7.07□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 SCAND1P57086 179 aa7.07□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 RBP5P82980 135 aa7.07□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 E2F5Q15329 346 aa7.07□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 IL17AQ16552 155 aa7.07□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 KCNT1Q5JUK3 1230 aa7.07□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 ARHGAP40Q5TG30 622 aa7.07□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 PGM2L1Q6PCE3 622 aa7.07□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 SKAP1Q86WV1 359 aa7.07□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa7.07□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 NECAB1Q8N987 351 aa7.07□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 CLRN3Q8NCR9 226 aa7.07□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa7.07□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 DLG3Q92796 817 aa7.07□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 GBP4Q96PP9 640 aa7.07□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa7.07□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 FIZ1Q96SL8 496 aa7.07□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 REEP2Q9BRK0 252 aa7.07□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 BBS2Q9BXC9 721 aa7.07□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 PARVGQ9HBI0 331 aa7.07□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 CPNE5Q9HCH3 593 aa7.07□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 DTLQ9NZJ0 730 aa7.07□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 KLHL14Q9P2G3 628 aa7.07□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 FBXO10Q9UK96 956 aa7.07□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa7.07□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 SPEF1Q9Y4P9 236 aa7.07□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 MRFAP1Q9Y605 127 aa7.07□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 THADAQ6YHU6 1953 aa7.07□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 TISP43B9A030 160 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 VILLO15195 856 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 YKT6O15498 198 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 TSPAN3O60637 253 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 JAK2O60674 1132 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 ACADMP11310 421 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 FAHP16930 419 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 GLDCP23378 1020 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 WARSP23381 471 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 IRAK1P51617 712 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 CACNA2D1P54289 1103 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 EPHB1P54762 984 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 IL9RQ01113 521 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 DNAJC3Q13217 504 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 POSTNQ15063 836 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 TERF2Q15554 542 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 ME3Q16798 604 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 NUP93Q8N1F7 819 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 MYCT1Q8N699 235 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 ZNF610Q8N9Z0 462 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 SAP25Q8TEE9 199 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 FAM168AQ92567 244 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 WBP2Q969T9 261 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 BIRC7Q96CA5 298 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 DIRC2Q96SL1 478 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 MENTQ9BUN1 341 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 DPH1Q9BZG8 443 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 TRIM9Q9C026 710 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 ELOVL4Q9GZR5 314 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 TMEM30AQ9NV96 361 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 C14orf119Q9NWQ9 140 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 IL37Q9NZH6 218 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 SIX4Q9UIU6 781 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00640-204ENST00000557295 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.8 ms