RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	MON1A	Q86VX9	555 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	TMC8	Q8IU68	726 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	FUK	Q8N0W3	1084 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	NEK11	Q8NG66	645 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	SPATA17	Q96L03	361 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	C8orf48	Q96LL4	319 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	PKMYT1	Q99640	499 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	MIS12	Q9H081	205 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	IFT22	Q9H7X7	185 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	ZMAT4	Q9H898	229 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	HEBP1	Q9NRV9	189 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	TDP1	Q9NUW8	608 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	EML5	Q05BV3	1969 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	COL4A3	Q01955	1670 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	DOCK9	Q9BZ29	2069 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	ANHX	E9PGG2	379 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288		M0QYV0	167 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	ECI2	O75521	394 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	NOL4	O94818	638 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	TBX18	O95935	607 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	PRL	P01236	227 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	RALA	P11233	206 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	RARG	P13631	454 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	CPE	P16870	476 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	BPI	P17213	487 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	HOXA5	P20719	270 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	LSP1	P33241	339 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	ID4	P47928	161 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	PPP3CC	P48454	512 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	IFNAR2	P48551	515 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	KLK7	P49862	253 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	TKTL1	P51854	596 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC5A3	P53794	718 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	NFKB2	Q00653	900 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	INCA1	Q0VD86	236 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	EFEMP1	Q12805	493 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	LRRC32	Q14392	662 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	SYCP1	Q15431	976 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	CNGA2	Q16280	664 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	TAF3	Q5VWG9	929 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	VIT	Q6UXI7	678 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	CLEC20A	Q6ZU45	233 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	LMO3	Q8TAP4	145 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	RNF139	Q8WU17	664 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	TFAP2B	Q92481	460 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	GOLGA1	Q92805	767 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM81B	Q96LP2	452 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	SPAG5	Q96R06	1193 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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