RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552985.5

TPCN1-223, Transcript of two pore segment channel 1, human

TSL 3

Gene TPCN1, Length 762 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPCN1-223	ENST00000552985	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TPCN1-223	ENST00000552985	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TPCN1-223	ENST00000552985	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TPCN1-223	ENST00000552985	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TPCN1-223	ENST00000552985	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TPCN1-223	ENST00000552985	PQLC3	Q8N755	202 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TPCN1-223	ENST00000552985	SPC24	Q8NBT2	197 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TPCN1-223	ENST00000552985	FAF2	Q96CS3	445 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TPCN1-223	ENST00000552985	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TPCN1-223	ENST00000552985	SERAC1	Q96JX3	654 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TPCN1-223	ENST00000552985	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TPCN1-223	ENST00000552985	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TPCN1-223	ENST00000552985	GOLPH3	Q9H4A6	298 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TPCN1-223	ENST00000552985	PREB	Q9HCU5	417 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TPCN1-223	ENST00000552985	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TPCN1-223	ENST00000552985	GGT7	Q9UJ14	662 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TPCN1-223	ENST00000552985	ITM2B	Q9Y287	266 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TPCN1-223	ENST00000552985	CA5B	Q9Y2D0	317 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TPCN1-223	ENST00000552985	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
TPCN1-223	ENST00000552985	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TPCN1-223	ENST00000552985	SNX11	Q9Y5W9	270 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TPCN1-223	ENST00000552985	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
TPCN1-223	ENST00000552985	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	KCNK3	O14649	394 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC31A1	O15431	190 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	MAFK	O60675	156 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	PCDH8	O95206	1070 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	NDUFA10	O95299	355 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	MAP3K6	O95382	1288 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	ITIH2	P19823	946 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	COMT	P21964	271 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	KDELR1	P24390	212 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	CDC25B	P30305	580 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	RACK1	P63244	317 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	FGL2	Q14314	439 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	PDK2	Q15119	407 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	SPA17	Q15506	151 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	TEAD4	Q15561	434 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	HLA-B	Q31612	363 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	HORMAD1	Q86X24	394 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	TMEM139	Q8IV31	216 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	PGBD5	Q8N414	524 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	MYOC	Q99972	504 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF670	Q9BS34	389 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	GAREM1	Q9H706	876 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	FZD3	Q9NPG1	666 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	LRRD1	A4D1F6	860 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	GIPC1	O14908	333 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	VILL	O15195	856 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	AP1G1	O43747	822 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	OPHN1	O60890	802 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	TNNT1	P13805	278 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	CD59	P13987	128 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	TIMP2	P16035	220 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	KCNA4	P22459	653 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	CD38	P28907	300 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	SERPINB6	P35237	376 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	CTSK	P43235	329 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	CSNK1D	P48730	415 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	GBE1	Q04446	702 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	RAD51	Q06609	339 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	GALNT2	Q10471	571 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	PPM1J	Q5JR12	505 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	NEK5	Q6P3R8	708 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	SRL	Q86TD4	932 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms