RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 MMP20O60882 483 aa16.37■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 CD160O95971 181 aa16.37■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 UGT2B4P06133 528 aa16.37■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 TSHRP16473 764 aa16.37■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 SLC5A2P31639 672 aa16.37■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 IGFALSP35858 605 aa16.37■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 ARL13BQ3SXY8 428 aa16.37■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 BRMS1LQ5PSV4 323 aa16.37■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 RETSATQ6NUM9 610 aa16.37■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa16.37■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 FAM131BQ86XD5 332 aa16.37■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 EXTL1Q92935 676 aa16.37■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 KLHL32Q96NJ5 620 aa16.37■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 MAGEB5Q9BZ81 275 aa16.37■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 NDFIP2Q9NV92 336 aa16.37■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 ZNF212Q9UDV6 495 aa16.37■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 PADI4Q9UM07 663 aa16.37■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 ILVBLA1L0T0 632 aa16.36■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 AP1G1O43747 822 aa16.36■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 GNA14O95837 355 aa16.36■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 CLCN1P35523 988 aa16.36■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 RPIAP49247 311 aa16.36■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 MARSP56192 900 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 CCL7P80098 99 aa16.36■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 GNA12Q03113 381 aa16.36■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 PTK2Q05397 1052 aa16.36■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 PAK1Q13153 545 aa16.36■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 MORC3Q14149 939 aa16.36■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 TRNP1Q6NT89 227 aa16.36■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 RD3Q7Z3Z2 195 aa16.36■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 CLEC14AQ86T13 490 aa16.36■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa16.36■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 FBXO39Q8N4B4 442 aa16.36■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 KYQ8NBH2 561 aa16.36■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 TPCN2Q8NHX9 752 aa16.36■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 BTN2A2Q8WVV5 523 aa16.36■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 SHC3Q92529 594 aa16.36■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 GLMNQ92990 594 aa16.36■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 CCDC74AQ96AQ1 378 aa16.36■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 TIGD1Q96MW7 591 aa16.36■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 SLC13A1Q9BZW2 595 aa16.36■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 CEP44Q9C0F1 390 aa16.36■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 PDCL3Q9H2J4 239 aa16.36■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa16.36■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 APEX2Q9UBZ4 518 aa16.36■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 STAP1Q9ULZ2 295 aa16.36■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 DOLKQ9UPQ8 538 aa16.36■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 COQ6Q9Y2Z9 468 aa16.36■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa16.35■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 TPP1O14773 563 aa16.35■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 TSPAN6O43657 245 aa16.35■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 TCEA3O75764 348 aa16.35■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 UGT1A5P35504 534 aa16.35■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 FLT3P36888 993 aa16.35■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 MTA1Q13330 715 aa16.35■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 TAF3Q5VWG9 929 aa16.35■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 GBP6Q6ZN66 633 aa16.35■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 USP53Q70EK8 1073 aa16.35■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 RAB11FIP2Q7L804 512 aa16.35■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa16.35■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 HID1Q8IV36 788 aa16.35■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 CFAP57Q96MR6 1250 aa16.35■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa16.35■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 ZYG11BQ9C0D3 744 aa16.35■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 DNAI1Q9UI46 699 aa16.35■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 DNAJC12Q9UKB3 198 aa16.35■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 BSNQ9UPA5 3926 aa16.35■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 LMO7DNF2Z398 122 aa16.34■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 PLD2O14939 933 aa16.34■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 NOBOXO60393 691 aa16.34■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 ITGA2BP08514 1039 aa16.34■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 PON1P27169 355 aa16.34■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 PPP1R2P41236 205 aa16.34■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 PTK2BQ14289 1009 aa16.34■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 ZNF805Q5CZA5 627 aa16.34■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 TTC7BQ86TV6 843 aa16.34■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 VASH2Q86V25 355 aa16.34■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 PCDH19Q8TAB3 1148 aa16.34■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 NAT6Q93015 286 aa16.34■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 NT5C3BQ969T7 300 aa16.34■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 VOPP1Q96AW1 172 aa16.34■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 CENPTQ96BT3 561 aa16.34■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 GRAMD1AQ96CP6 724 aa16.34■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 C1orf74Q96LT6 269 aa16.34■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 SIX2Q9NPC8 291 aa16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms