RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	CYP1A2	P05177	515 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	TPM3	P06753	285 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	FAM228B	P0C875	321 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	AKT2	P31751	481 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	CSNK1D	P48730	415 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	RAD51	Q06609	339 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	DPYS	Q14117	519 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	GRM3	Q14832	879 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	DPYSL2	Q16555	572 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	TEKT4	Q8WW24	435 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	ZDHHC6	Q9H6R6	413 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	LHX3	Q9UBR4	397 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	KLK13	Q9UKR3	277 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	NENF	Q9UMX5	172 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	11.65	□□□□□ -0.54	6e-6	■□□□□ 9.1
CS-223	ENST00000551137	TSPAN11	A1L157	253 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	SLC31A1	O15431	190 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	SPINT1	O43278	529 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	IGSF6	O95976	241 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	UGT2B4	P06133	528 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	ITGAV	P06756	1048 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	C1S	P09871	688 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	CDK4	P11802	303 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	PRLR	P16471	622 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	ERCC2	P18074	760 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	SPINK2	P20155	84 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	11.64	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	FGL2	Q14314	439 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	CYTH1	Q15438	398 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	ST3GAL2	Q16842	350 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	FAM71B	Q8TC56	605 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	SPOCK2	Q92563	424 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	UBA2	Q9UBT2	640 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	PTPRB	P23467	1997 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	ACACA	Q13085	2346 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137		J3KR12	359 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	CAPNS1	P04632	268 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	C1QTNF9	P0C862	333 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	THEGL	P0DJG4	465 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	IL1R2	P27930	398 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	CASP14	P31944	242 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	GK	P32189	559 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	ABL2	P42684	1182 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	RHOA	P61586	193 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	IL10RB	Q08334	325 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	TRIM14	Q14142	442 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	OR6K2	Q8NGY2	324 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	TSC1	Q92574	1164 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	BMF	Q96LC9	184 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	ZNF641	Q96N77	438 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	ZNF599	Q96NL3	588 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	DNAJC7	Q99615	494 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	11.63	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	THAP2	Q9H0W7	228 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	ZWILCH	Q9H900	591 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CS-223	ENST00000551137	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		11.63	□□□□□ -0.55

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