RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 TACR2P21452 398 aa20.51■□□□□ 0.87
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PACSIN3-211ENST00000539589 CLNKQ7Z7G1 428 aa20.51■□□□□ 0.87
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PACSIN3-211ENST00000539589 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa20.51■□□□□ 0.87
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PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC149Q6ZUS6 474 aa20.5■□□□□ 0.87
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PACSIN3-211ENST00000539589 DENND1CQ8IV53 801 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 AZIN2Q96A70 460 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF778Q96MU6 729 aa20.5■□□□□ 0.87
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PACSIN3-211ENST00000539589 IRF1P10914 325 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 CDK18Q07002 472 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 SNCBQ16143 134 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 CES4AQ5XG92 561 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 MBLAC2Q68D91 279 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa20.49■□□□□ 0.87
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PACSIN3-211ENST00000539589 MRGPRX2Q96LB1 330 aa20.49■□□□□ 0.87
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PACSIN3-211ENST00000539589 HAO1Q9UJM8 370 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 CCL16O15467 120 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 OLFM2O95897 454 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 C5orf22Q49AR2 442 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 MARC1Q5VT66 337 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 RANBP10Q6VN20 620 aa20.49■□□□□ 0.87
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PACSIN3-211ENST00000539589 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 INPP5DQ92835 1189 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 VPS39Q96JC1 886 aa20.49■□□□□ 0.87
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PACSIN3-211ENST00000539589 TUBB6Q9BUF5 446 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM216Q9P0N5 145 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 RFPL2O75678 378 aa20.48■□□□□ 0.87
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PACSIN3-211ENST00000539589 T-ENOLP0DO92 83 aa20.48■□□□□ 0.87
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PACSIN3-211ENST00000539589 SERPINB3P29508 390 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 PBX2P40425 430 aa20.48■□□□□ 0.87
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PACSIN3-211ENST00000539589 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF354CQ86Y25 554 aa20.48■□□□□ 0.87
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PACSIN3-211ENST00000539589 CFAP52Q8N1V2 620 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 SKA1Q96BD8 255 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 TCAF1Q9Y4C2 921 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 A0A096LPK6 155 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC78A2IDD5 438 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 GOLGA8TH3BQL2 631 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 J3KR12 359 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 HAUS5O94927 633 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 KRT16P08779 473 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 PAMP19021 973 aa20.48■□□□□ 0.87
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