RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523440.1

ADAM28-212, Transcript of ADAM metallopeptidase domain 28, human

TSL 3

Gene ADAM28, Length 522 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ADAM28-212	ENST00000523440	TOP1MT	Q969P6	601 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	EMSY	Q7Z589	1322 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	TNFRSF6B	O95407	300 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	IDE	P14735	1019 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	CXCR5	P32302	372 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	HTR7	P34969	479 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	NRIP1	P48552	1158 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	E2F1	Q01094	437 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	MAPK7	Q13164	816 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	ERAP2	Q6P179	960 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	MZT2A	Q6P582	158 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	SERINC5	Q86VE9	423 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	SPATA33	Q96N06	139 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	PRR25	Q96S07	402 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	RMDN3	Q96TC7	470 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	FSD1	Q9BTV5	496 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	SETD4	Q9NVD3	440 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	RNF7	Q9UBF6	113 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	CACNA1G	O43497	2377 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	PRR23A	A6NEV1	266 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440		H0YIZ8	118 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	HAS3	O00219	553 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	PER2	O15055	1255 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	SPRY2	O43597	315 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	ASNA1	O43681	348 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	SNX2	O60749	519 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	TCEA3	O75764	348 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	USP1	O94782	785 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	GGPS1	O95749	300 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	RB1	P06400	928 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	PDHB	P11177	359 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	NDUFB7	P17568	137 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	DNAJB1	P25685	340 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	ITPKB	P27987	946 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	RBL1	P28749	1068 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	TPTE	P56180	551 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	CAMK1	Q14012	370 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	SPARCL1	Q14515	664 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	PFKFB4	Q16877	469 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440		Q6ZWC4	215 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	PPTC7	Q8NI37	304 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	PPCS	Q9HAB8	311 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ADAM28-212	ENST00000523440	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		4.34	□□□□□ -1.71

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