RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 TSPAN6O43657 245 aa21.37■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 AP1G1O43747 822 aa21.37■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF883P0CG24 379 aa21.37■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 AKT2P31751 481 aa21.37■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 OVGP1Q12889 678 aa21.37■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 SGCGQ13326 291 aa21.37■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa21.37■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 LRRC49Q8IUZ0 686 aa21.37■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa21.37■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 ATPAF2Q8N5M1 289 aa21.37■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 MFSD2AQ8NA29 543 aa21.37■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 RFFLQ8WZ73 363 aa21.37■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF599Q96NL3 588 aa21.37■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 EBF2Q9HAK2 575 aa21.37■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 PDFQ9HBH1 243 aa21.37■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 GDF3Q9NR23 364 aa21.37■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 TM7SF3Q9NS93 570 aa21.37■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 SEPT3Q9UH03 358 aa21.37■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 TLR4O00206 839 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC31A1O15431 190 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 NOP2P46087 812 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 SUOXP51687 545 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 IQCHQ86VS3 1027 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 NPWQ8N729 165 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 NETO2Q8NC67 525 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 DEFB124Q8NES8 71 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 HCAR2Q8TDS4 363 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 EXOC2Q96KP1 924 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 PANX2Q96RD6 677 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 LHX3Q9UBR4 397 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 FADS3Q9Y5Q0 445 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 PCDH15Q96QU1 1955 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 CACNA1EQ15878 2313 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 MTA2O94776 668 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC1A1P43005 524 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 CSNK1DP48730 415 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF235Q14590 738 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 LBRQ14739 615 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 SRLQ86TD4 932 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 TMTC1Q8IUR5 882 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM174AQ8TBP5 190 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM71BQ8TC56 605 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 TSC1Q92574 1164 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 KLK6Q92876 244 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF670Q9BS34 389 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC17A9Q9BYT1 436 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 SUV39H2Q9H5I1 410 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 HAUS2Q9NVX0 235 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 DKK3Q9UBP4 350 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 DCHS1Q96JQ0 3298 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 C10orf142B7Z368 130 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 RNF103O00237 685 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 GJB3O75712 270 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 SERPINA4P29622 427 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 CTSKP43235 329 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 CCT8P50990 548 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 BNC1Q01954 994 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 MMRN1Q13201 1228 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 DPYSL3Q14195 570 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF284Q2VY69 593 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 INAVAQ3KP66 663 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 LAYNQ6UX15 382 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 GAS2L3Q86XJ1 694 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 OXR1Q8N573 874 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 KLHDC7BQ96G42 594 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 IL21RQ9HBE5 538 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 ETNK2Q9NVF9 386 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 KCNK3O14649 394 aa21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 CD59P13987 128 aa21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 PRLRP16471 622 aa21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 IL4RP24394 825 aa21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 TAS2R40P59535 323 aa21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 BCL2L1Q07817 233 aa21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 ELP6Q0PNE2 266 aa21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 TCEAL1Q15170 157 aa21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF423Q2M1K9 1284 aa21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 ERAP2Q6P179 960 aa21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 PIP4P1Q86T03 277 aa21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 CXorf40AQ8TE69 158 aa21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 PSKH2Q96QS6 385 aa21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms