RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498224.5

SLC20A1-209, Transcript of solute carrier family 20 member 1, humanhuman

TSL 2

Gene SLC20A1, Length 692 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC20A1-209ENST00000498224 OTUB2Q96DC9 234 aa10.66□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 SMC6Q96SB8 1091 aa10.66□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 MGME1Q9BQP7 344 aa10.66□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 KIFC1Q9BW19 673 aa10.66□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 PLAC1Q9HBJ0 212 aa10.66□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 FAM169AQ9Y6X4 670 aa10.66□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa10.65□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 INSIG1O15503 277 aa10.65□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 ZMPSTE24O75844 475 aa10.65□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 KRT38O76015 456 aa10.65□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 C1QAP02745 245 aa10.65□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 MT-ND3P03897 115 aa10.65□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 CEBPBP17676 345 aa10.65□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 PAMP19021 973 aa10.65□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 HLA-DPA1P20036 260 aa10.65□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 GLDCP23378 1020 aa10.65□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 ADRA1DP25100 572 aa10.65□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 GNGT1P63211 74 aa10.65□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 ARF5P84085 180 aa10.65□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 CDK18Q07002 472 aa10.65□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 SLC20A2Q08357 652 aa10.65□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP10.65□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 USP4Q13107 963 aa10.65□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 CYTH1Q15438 398 aa10.65□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 ZNF77Q15935 545 aa10.65□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 RALGPS1Q5JS13 557 aa10.65□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 RNF43Q68DV7 783 aa10.65□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 PKN3Q6P5Z2 889 aa10.65□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 TMC5Q6UXY8 1006 aa10.65□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 TPGS1Q6ZTW0 290 aa10.65□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 NLRP9Q7RTR0 991 aa10.65□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 CENPTQ96BT3 561 aa10.65□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 MTBPQ96DY7 904 aa10.65□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 CERS2Q96G23 380 aa10.65□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 FEM1CQ96JP0 617 aa10.65□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 NUDCD1Q96RS6 583 aa10.65□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 RANBP9Q96S59 729 aa10.65□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 TRABDQ9H4I3 376 aa10.65□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 KCNK9Q9NPC2 374 aa10.65□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 SCUBE2Q9NQ36 999 aa10.65□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 CHRAC1Q9NRG0 131 aa10.65□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa10.65□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 TXNDC16Q9P2K2 825 aa10.65□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 CCL26Q9Y258 94 aa10.65□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 TCAF1Q9Y4C2 921 aa10.65□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 OR51B4Q9Y5P0 310 aa10.65□□□□□ -0.7
SLC20A1-209ENST00000498224 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa10.64□□□□□ -0.71
SLC20A1-209ENST00000498224 HEATR9A2RTY3 570 aa10.64□□□□□ -0.71
SLC20A1-209ENST00000498224 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
SLC20A1-209ENST00000498224 MUSKO15146 869 aa10.64□□□□□ -0.71
SLC20A1-209ENST00000498224 TMCC1O94876 653 aa10.64□□□□□ -0.71
SLC20A1-209ENST00000498224 PRAMEF12O95522 483 aa10.64□□□□□ -0.71
SLC20A1-209ENST00000498224 PENKP01210 267 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
SLC20A1-209ENST00000498224 FGF1P05230 155 aa10.64□□□□□ -0.71
SLC20A1-209ENST00000498224 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
SLC20A1-209ENST00000498224 CHN1P15882 459 aa10.64□□□□□ -0.71
SLC20A1-209ENST00000498224 CA4P22748 312 aa10.64□□□□□ -0.71
SLC20A1-209ENST00000498224 BMP8BP34820 402 aa10.64□□□□□ -0.71
SLC20A1-209ENST00000498224 SCNN1BP51168 640 aa10.64□□□□□ -0.71
SLC20A1-209ENST00000498224 PLK1P53350 603 aa10.64□□□□□ -0.71
SLC20A1-209ENST00000498224 SLC18A1P54219 525 aa10.64□□□□□ -0.71
SLC20A1-209ENST00000498224 KCNC3Q14003 757 aa10.64□□□□□ -0.71
SLC20A1-209ENST00000498224 POU6F1Q14863 301 aa10.64□□□□□ -0.71
SLC20A1-209ENST00000498224 SLC1A5Q15758 541 aa10.64□□□□□ -0.71
SLC20A1-209ENST00000498224 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
SLC20A1-209ENST00000498224 PDPK2PQ6A1A2 396 aa10.64□□□□□ -0.71
SLC20A1-209ENST00000498224 KDELC2Q7Z4H8 507 aa10.64□□□□□ -0.71
SLC20A1-209ENST00000498224 RASSF3Q86WH2 238 aa10.64□□□□□ -0.71
SLC20A1-209ENST00000498224 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
SLC20A1-209ENST00000498224 SLC25A41Q8N5S1 370 aa10.64□□□□□ -0.71
SLC20A1-209ENST00000498224 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
SLC20A1-209ENST00000498224 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
SLC20A1-209ENST00000498224 IRF7Q92985 503 aa10.64□□□□□ -0.71
SLC20A1-209ENST00000498224 BHMTQ93088 406 aa10.64□□□□□ -0.71
SLC20A1-209ENST00000498224 ALG14Q96F25 216 aa10.64□□□□□ -0.71
SLC20A1-209ENST00000498224 ZSWIM3Q96MP5 696 aa10.64□□□□□ -0.71
SLC20A1-209ENST00000498224 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
SLC20A1-209ENST00000498224 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
SLC20A1-209ENST00000498224 SPHK2Q9NRA0 654 aa10.64□□□□□ -0.71
SLC20A1-209ENST00000498224 SMYD2Q9NRG4 433 aa10.64□□□□□ -0.71
SLC20A1-209ENST00000498224 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
SLC20A1-209ENST00000498224 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa10.64□□□□□ -0.71
SLC20A1-209ENST00000498224 ZFATQ9P243 1243 aa10.64□□□□□ -0.71
SLC20A1-209ENST00000498224 PRKAG3Q9UGI9 489 aa10.64□□□□□ -0.71
SLC20A1-209ENST00000498224 VPS51Q9UID3 782 aa10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms