RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 TXLNGQ9NUQ3 528 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 TXNDC16Q9P2K2 825 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 CDH9Q9ULB4 789 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 FBXO21O94952 628 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 IGLV3-19P01714 112 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 DHRS4L1P0CG22 281 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 T-ENOLP0DO92 83 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 PGFP49763 221 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 PGGT1BP53609 377 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 ARHGAP8P85298 464 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 PARP6Q2NL67 630 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 ARL13BQ3SXY8 428 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 CERCAMQ5T4B2 595 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 C4orf22Q6V702 233 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 TMEM86AQ8N2M4 240 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 URGCPQ8TCY9 931 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 AGAP11Q8TF27 550 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 SUSD3Q96L08 255 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 ARHGEF3Q9NR81 526 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 DLL3Q9NYJ7 618 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 UBAP1Q9NZ09 502 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 HHLA1C9JL84 531 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 DFFAO00273 331 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 C2CD2LO14523 706 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 TPP1O14773 563 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 ODC1P11926 461 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 NFKB1P19838 968 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 SAT1P21673 171 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 HOXD12P35452 270 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 CPA2P48052 419 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 CCL23P55773 120 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 ZBTB17Q13105 803 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 MYBPC3Q14896 1274 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 MAP7D1Q3KQU3 841 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 OVOS1Q6IE37 1185 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 LRRC8BQ6P9F7 803 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 ASRGL1Q7L266 308 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 CLNKQ7Z7G1 428 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 CMC1Q7Z7K0 106 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 RASSF3Q86WH2 238 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 METTL23Q86XA0 190 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 GDPD5Q8WTR4 605 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 CDKL2Q92772 493 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 MFSD3Q96ES6 412 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 TTLL2Q9BWV7 592 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 PREBQ9HCU5 417 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 ZNF358Q9NW07 568 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 MOCS1Q9NZB8 636 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 ZNF180Q9UJW8 692 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 GRXCR1A8MXD5 290 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 E2F6O75461 281 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 GRIK1P39086 918 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 GLUD2P49448 558 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 PACS1Q6VY07 963 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 LONP2Q86WA8 852 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 FAM217AQ8IXS0 508 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 AGAP2Q99490 1192 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 C20orf27Q9GZN8 174 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 NACA2Q9H009 215 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 RETREG1Q9H6L5 497 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 EBF2Q9HAK2 575 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 CD320Q9NPF0 282 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 ARL8BQ9NVJ2 186 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 PRR23AA6NEV1 266 aa7.11□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 OR6C75A6NL08 312 aa7.11□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 B4GALT3O60512 393 aa7.11□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 HAUS5O94927 633 aa7.11□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 MYCP01106 439 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 CCNB1P14635 433 aa7.11□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 TYK2P29597 1187 aa7.11□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 ERFP50548 548 aa7.11□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 TUSC3Q13454 348 aa7.11□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 CCDC80Q76M96 950 aa7.11□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 BHLHA9Q7RTU4 235 aa7.11□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 CHSY1Q86X52 802 aa7.11□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 SPATA22Q8NHS9 363 aa7.11□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 GPR152Q8TDT2 470 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms