RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488279.6

PTPN4-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4, humanhuman

TSL 5

Gene PTPN4, Length 662 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN4-211ENST00000488279 CLDN6P56747 220 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.265e-6■□□□□ 11.3
PTPN4-211ENST00000488279 PARP15Q460N3 678 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 HES3Q5TGS1 186 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 C19orf48Q6RUI8 117 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 TTC7BQ86TV6 843 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 HMCESQ96FZ2 354 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 PARVAQ9NVD7 372 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 DNAJC28Q9NX36 388 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 TAS2R14Q9NYV8 317 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 TMEM63CQ9P1W3 806 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 TMCO5BA8MYB1 307 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 RASA4BC9J798 803 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 FFAR2O15552 330 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 RASA4O43374 803 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 IGSF6O95976 241 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 ALPPL2P10696 532 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 HTR7P34969 479 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 ABL2P42684 1182 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 E2F1Q01094 437 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 MAMLD1Q13495 774 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 SERINC3Q13530 473 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 FILIP1LQ4L180 1135 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 ZNF542PQ5EBM4 170 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 TMC6Q7Z403 805 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 ASB12Q8WXK4 309 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 BAP1Q92560 729 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 VOPP1Q96AW1 172 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 SYT11Q9BT88 431 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 KNTC1P50748 2209 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 RHOAP61586 193 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 DAB2P98082 770 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 OGDHQ02218 1023 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 NXPE2Q96DL1 559 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 KLC2Q9H0B6 622 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 GPR27Q9NS67 375 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 GGT7Q9UJ14 662 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 ITM2BQ9Y287 266 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 AREL1O15033 823 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 SCAMP1O15126 338 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 PSMA2P25787 234 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 TPI1P60174 286 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 FZD2Q14332 565 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 NETO2Q8NC67 525 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 DENND6BQ8NEG7 585 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 RFFLQ8WZ73 363 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 DUSP23Q9BVJ7 150 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 NLGN3Q9NZ94 848 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 DKK3Q9UBP4 350 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPN4-211ENST00000488279 LRRC53A6NM62 1247 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPN4-211ENST00000488279 CSF2P04141 144 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPN4-211ENST00000488279 GIMD1P0DJR0 217 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPN4-211ENST00000488279 CKMT1AP12532 417 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPN4-211ENST00000488279 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
PTPN4-211ENST00000488279 ASIC2Q16515 512 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPN4-211ENST00000488279 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPN4-211ENST00000488279 PARGQ86W56 976 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPN4-211ENST00000488279 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
PTPN4-211ENST00000488279 SCUBE2Q9NQ36 999 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPN4-211ENST00000488279 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
PTPN4-211ENST00000488279 CLCA2Q9UQC9 943 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPN4-211ENST00000488279 AK5Q9Y6K8 562 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPN4-211ENST00000488279 TRPM6Q9BX84 2022 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPN4-211ENST00000488279 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
PTPN4-211ENST00000488279 ACACAQ13085 2346 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPN4-211ENST00000488279 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
PTPN4-211ENST00000488279 H3BM21 787 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPN4-211ENST00000488279 SPINT1O43278 529 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPN4-211ENST00000488279 NME1P15531 152 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
PTPN4-211ENST00000488279 NDST2P52849 883 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPN4-211ENST00000488279 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
PTPN4-211ENST00000488279 CYTH1Q15438 398 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPN4-211ENST00000488279 COL28A1Q2UY09 1125 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPN4-211ENST00000488279 CXorf40AQ8TE69 158 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPN4-211ENST00000488279 CENPTQ96BT3 561 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPN4-211ENST00000488279 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
PTPN4-211ENST00000488279 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPN4-211ENST00000488279 NRSN2Q9GZP1 204 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPN4-211ENST00000488279 HAUS4Q9H6D7 363 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPN4-211ENST00000488279 CAAP1Q9H8G2 361 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPN4-211ENST00000488279 AIPL1Q9NZN9 384 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPN4-211ENST00000488279 AP4E1Q9UPM8 1137 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPN4-211ENST00000488279 APC2O95996 2303 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPN4-211ENST00000488279 CHD5Q8TDI0 1954 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPN4-211ENST00000488279 K7ESM1 405 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPN4-211ENST00000488279 MMP20O60882 483 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPN4-211ENST00000488279 TM7SF2O76062 418 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPN4-211ENST00000488279 FTLP02792 175 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
PTPN4-211ENST00000488279 GZMAP12544 262 aa22.87■■□□□ 1.25
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