RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470271.5

CTPS1-206, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-206ENST00000470271 SKA1Q96BD8 255 aa20.17■□□□□ 0.82
CTPS1-206ENST00000470271 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
CTPS1-206ENST00000470271 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CTPS1-206ENST00000470271 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CTPS1-206ENST00000470271 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa20.17■□□□□ 0.82
CTPS1-206ENST00000470271 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa20.17■□□□□ 0.82
CTPS1-206ENST00000470271 FADS3Q9Y5Q0 445 aa20.17■□□□□ 0.82
CTPS1-206ENST00000470271 VILLO15195 856 aa20.16■□□□□ 0.82
CTPS1-206ENST00000470271 INSIG1O15503 277 aa20.16■□□□□ 0.82
CTPS1-206ENST00000470271 AP1G1O43747 822 aa20.16■□□□□ 0.82
CTPS1-206ENST00000470271 FECHP22830 423 aa20.16■□□□□ 0.82
CTPS1-206ENST00000470271 GRM3Q14832 879 aa20.16■□□□□ 0.82
CTPS1-206ENST00000470271 HLA-BQ31612 363 aa20.16■□□□□ 0.82
CTPS1-206ENST00000470271 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa20.16■□□□□ 0.82
CTPS1-206ENST00000470271 PPM1JQ5JR12 505 aa20.16■□□□□ 0.82
CTPS1-206ENST00000470271 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa20.16■□□□□ 0.82
CTPS1-206ENST00000470271 ATPAF2Q8N5M1 289 aa20.16■□□□□ 0.82
CTPS1-206ENST00000470271 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CTPS1-206ENST00000470271 PCDH19Q8TAB3 1148 aa20.16■□□□□ 0.82
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF599Q96NL3 588 aa20.16■□□□□ 0.82
CTPS1-206ENST00000470271 GAREM1Q9H706 876 aa20.16■□□□□ 0.82
CTPS1-206ENST00000470271 SNX11Q9Y5W9 270 aa20.16■□□□□ 0.82
CTPS1-206ENST00000470271 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CTPS1-206ENST00000470271 TRPM6Q9BX84 2022 aa20.15■□□□□ 0.82
CTPS1-206ENST00000470271 SOWAHDA6NJG2 315 aa20.15■□□□□ 0.82
CTPS1-206ENST00000470271 WNT9AO14904 365 aa20.15■□□□□ 0.82
CTPS1-206ENST00000470271 GJB3O75712 270 aa20.15■□□□□ 0.82
CTPS1-206ENST00000470271 CD38P28907 300 aa20.15■□□□□ 0.82
CTPS1-206ENST00000470271 CDC25BP30305 580 aa20.15■□□□□ 0.82
CTPS1-206ENST00000470271 SLC1A1P43005 524 aa20.15■□□□□ 0.82
CTPS1-206ENST00000470271 NOP2P46087 812 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
CTPS1-206ENST00000470271 CSNK1DP48730 415 aa20.15■□□□□ 0.82
CTPS1-206ENST00000470271 C21orf59P57076 290 aa20.15■□□□□ 0.82
CTPS1-206ENST00000470271 LBRQ14739 615 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF284Q2VY69 593 aa20.15■□□□□ 0.82
CTPS1-206ENST00000470271 SLC45A4Q5BKX6 768 aa20.15■□□□□ 0.82
CTPS1-206ENST00000470271 TMCO4Q5TGY1 634 aa20.15■□□□□ 0.82
CTPS1-206ENST00000470271 RAPGEF5Q92565 580 aa20.15■□□□□ 0.82
CTPS1-206ENST00000470271 FAF2Q96CS3 445 aa20.15■□□□□ 0.82
CTPS1-206ENST00000470271 DKK3Q9UBP4 350 aa20.15■□□□□ 0.82
CTPS1-206ENST00000470271 SEPT3Q9UH03 358 aa20.15■□□□□ 0.82
CTPS1-206ENST00000470271 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa20.15■□□□□ 0.82
CTPS1-206ENST00000470271 A0A1W2PR77 199 aa20.14■□□□□ 0.81
CTPS1-206ENST00000470271 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa20.14■□□□□ 0.81
CTPS1-206ENST00000470271 SLC31A1O15431 190 aa20.14■□□□□ 0.81
CTPS1-206ENST00000470271 MAFKO60675 156 aa20.14■□□□□ 0.81
CTPS1-206ENST00000470271 NDUFA10O95299 355 aa20.14■□□□□ 0.81
CTPS1-206ENST00000470271 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CTPS1-206ENST00000470271 PIGNO95427 931 aa20.14■□□□□ 0.81
CTPS1-206ENST00000470271 WNT1P04628 370 aa20.14■□□□□ 0.81
CTPS1-206ENST00000470271 KCNA4P22459 653 aa20.14■□□□□ 0.81
CTPS1-206ENST00000470271 KDELR1P24390 212 aa20.14■□□□□ 0.81
CTPS1-206ENST00000470271 ABL2P42684 1182 aa20.14■□□□□ 0.81
CTPS1-206ENST00000470271 RGRP47804 291 aa20.14■□□□□ 0.81
CTPS1-206ENST00000470271 HADHBP55084 474 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CTPS1-206ENST00000470271 RPS21P63220 83 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CTPS1-206ENST00000470271 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.81
CTPS1-206ENST00000470271 SLC10A7Q0GE19 358 aa20.14■□□□□ 0.81
CTPS1-206ENST00000470271 SLC14A1Q13336 389 aa20.14■□□□□ 0.81
CTPS1-206ENST00000470271 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CTPS1-206ENST00000470271 LRRC38Q5VT99 294 aa20.14■□□□□ 0.81
CTPS1-206ENST00000470271 SEL1L3Q68CR1 1132 aa20.14■□□□□ 0.81
CTPS1-206ENST00000470271 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa20.14■□□□□ 0.81
CTPS1-206ENST00000470271 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa20.14■□□□□ 0.81
CTPS1-206ENST00000470271 SRLQ86TD4 932 aa20.14■□□□□ 0.81
CTPS1-206ENST00000470271 TTC7BQ86TV6 843 aa20.14■□□□□ 0.81
CTPS1-206ENST00000470271 LRRC49Q8IUZ0 686 aa20.14■□□□□ 0.81
CTPS1-206ENST00000470271 KLK6Q92876 244 aa20.14■□□□□ 0.81
CTPS1-206ENST00000470271 FEM1CQ96JP0 617 aa20.14■□□□□ 0.81
CTPS1-206ENST00000470271 PSKH2Q96QS6 385 aa20.14■□□□□ 0.81
CTPS1-206ENST00000470271 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa20.14■□□□□ 0.81
CTPS1-206ENST00000470271 IL21RQ9HBE5 538 aa20.14■□□□□ 0.81
CTPS1-206ENST00000470271 IMPACTQ9P2X3 320 aa20.14■□□□□ 0.81
CTPS1-206ENST00000470271 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CTPS1-206ENST00000470271 LRRD1A4D1F6 860 aa20.13■□□□□ 0.81
CTPS1-206ENST00000470271 UPK3BL1B0FP48 263 aa20.13■□□□□ 0.81
CTPS1-206ENST00000470271 UPK3BL2E5RIL1 263 aa20.13■□□□□ 0.81
CTPS1-206ENST00000470271 NEMP1O14524 444 aa20.13■□□□□ 0.81
CTPS1-206ENST00000470271 TSPAN6O43657 245 aa20.13■□□□□ 0.81
CTPS1-206ENST00000470271 MFSD11O43934 449 aa20.13■□□□□ 0.81
CTPS1-206ENST00000470271 KCNK5O95279 499 aa20.13■□□□□ 0.81
CTPS1-206ENST00000470271 PEX11BO96011 259 aa20.13■□□□□ 0.81
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF883P0CG24 379 aa20.13■□□□□ 0.81
CTPS1-206ENST00000470271 PRLRP16471 622 aa20.13■□□□□ 0.81
CTPS1-206ENST00000470271 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
CTPS1-206ENST00000470271 COMTP21964 271 aa20.13■□□□□ 0.81
CTPS1-206ENST00000470271 CTSKP43235 329 aa20.13■□□□□ 0.81
CTPS1-206ENST00000470271 RENBPP51606 427 aa20.13■□□□□ 0.81
CTPS1-206ENST00000470271 FOXK2Q01167 660 aa20.13■□□□□ 0.81
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF235Q14590 738 aa20.13■□□□□ 0.81
CTPS1-206ENST00000470271 STAT4Q14765 748 aa20.13■□□□□ 0.81
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM259Q4ZIN3 620 aa20.13■□□□□ 0.81
CTPS1-206ENST00000470271 ZSCAN30Q86W11 494 aa20.13■□□□□ 0.81
CTPS1-206ENST00000470271 RHOT1Q8IXI2 618 aa20.13■□□□□ 0.81
CTPS1-206ENST00000470271 MFSD2AQ8NA29 543 aa20.13■□□□□ 0.81
CTPS1-206ENST00000470271 HCAR2Q8TDS4 363 aa20.13■□□□□ 0.81
CTPS1-206ENST00000470271 NSMCE1Q8WV22 266 aa20.13■□□□□ 0.81
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
CTPS1-206ENST00000470271 SUV39H2Q9H5I1 410 aa20.13■□□□□ 0.81
CTPS1-206ENST00000470271 TFR2Q9UP52 801 aa20.13■□□□□ 0.81
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