RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464454.1

CLK1-208, Transcript of CDC like kinase 1, human

TSL 2

Gene CLK1, Length 484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLK1-208	ENST00000464454	BLK	P51451	505 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	CYP4A11	Q02928	519 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	PPAT	Q06203	517 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	TMEM81	Q6P7N7	255 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	PLD5	Q8N7P1	536 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	METTL6	Q8TCB7	284 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	ZBTB9	Q96C00	473 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454		A0A0A0MQY5	61 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	FAM157A	C9JC47	383 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454		H0YGN5	161 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	TNFSF14	O43557	240 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	ZBED4	O75132	1171 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	MMP3	P08254	477 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	FMO4	P31512	558 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	TNFSF8	P32971	234 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	DPP6	P42658	865 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	ENTPD1	P49961	510 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	PGGT1B	P53609	377 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	ARSF	P54793	590 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	DCAF7	P61962	342 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	FAM160B2	Q86V87	743 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	GPSM1	Q86YR5	675 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	TMC8	Q8IU68	726 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	KDM1B	Q8NB78	822 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	KLHL29	Q96CT2	875 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	CDH22	Q9UJ99	828 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454		A0A1W2PQM1	296 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	INSIG1	O15503	277 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	TACC1	O75410	805 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	CLEC3B	P05452	202 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	GALT	P07902	379 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	P2RX3	P56373	397 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	KRTAP10-11	P60412	298 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	SYTL3	Q4VX76	610 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	MOB3C	Q70IA8	216 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	SERPINA11	Q86U17	422 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	NGEF	Q8N5V2	710 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	KLHL15	Q96M94	604 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	ISCU	Q9H1K1	167 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	KRT84	Q9NSB2	600 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	KIAA1456	Q9P272	454 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	SWAP70	Q9UH65	585 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71

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