RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 DNAJC24Q6P3W2 148 aa21.3■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 OR6K2Q8NGY2 324 aa21.3■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa21.3■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 TTYH3Q9C0H2 523 aa21.3■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 HSD3B7Q9H2F3 369 aa21.3■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 H3BM21 787 aa21.29■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 KRIT1O00522 736 aa21.29■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 AREL1O15033 823 aa21.29■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 TMCC1O94876 653 aa21.29■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 UGT2B4P06133 528 aa21.29■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC172P0C7W6 258 aa21.29■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 GKP32189 559 aa21.29■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 HTR7P34969 479 aa21.29■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 PFN3P60673 137 aa21.29■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 SGCGQ13326 291 aa21.29■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 PARP15Q460N3 678 aa21.29■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa21.29■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 MCEEQ96PE7 176 aa21.29■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 EPAS1Q99814 870 aa21.29■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 CNPY3Q9BT09 278 aa21.29■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa21.29■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 EVA1BQ9NVM1 165 aa21.29■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 DNAJC28Q9NX36 388 aa21.29■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 FZD10Q9ULW2 581 aa21.29■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 MYO6Q9UM54 1294 aa21.29■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa21.29■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 IGLON5A6NGN9 336 aa21.28■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 FFAR2O15552 330 aa21.28■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 BUB1O43683 1085 aa21.28■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 IGSF6O95976 241 aa21.28■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 FERP16591 822 aa21.28■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 RAD51Q06609 339 aa21.28■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 GDPD4Q6W3E5 623 aa21.28■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa21.28■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 PYROXD2Q8N2H3 581 aa21.28■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 BAP1Q92560 729 aa21.28■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 VCPIP1Q96JH7 1222 aa21.28■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 APOLD1Q96LR9 279 aa21.28■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 KLHL32Q96NJ5 620 aa21.28■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 DONSONQ9NYP3 566 aa21.28■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 DKK3Q9UBP4 350 aa21.28■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 KNTC1P50748 2209 aa21.27■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa21.27■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 GOLGA6L22H0YM25 854 aa21.27■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 K7ESM1 405 aa21.27■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 NEMP1O14524 444 aa21.27■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 TOR1BO14657 336 aa21.27■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 DESP17661 470 aa21.27■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 SUOXP51687 545 aa21.27■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 SERINC3Q13530 473 aa21.27■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 CDCP2Q5VXM1 449 aa21.27■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 ACAD10Q6JQN1 1059 aa21.27■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 MCOLN2Q8IZK6 566 aa21.27■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 CENPTQ96BT3 561 aa21.27■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 TBATAQ96M53 351 aa21.27■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 SYT11Q9BT88 431 aa21.27■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa21.27■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 GGT7Q9UJ14 662 aa21.27■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 ITM2BQ9Y287 266 aa21.27■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 AK5Q9Y6K8 562 aa21.27■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 U3KQA8 63 aa21.27■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 URB1O60287 2271 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
LIMS1-208ENST00000428064 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
LIMS1-208ENST00000428064 MT-CO3P00414 261 aa21.26■□□□□ 0.99
LIMS1-208ENST00000428064 ABCG1P45844 678 aa21.26■□□□□ 0.99
LIMS1-208ENST00000428064 YPEL5P62699 121 aa21.26■□□□□ 0.99
LIMS1-208ENST00000428064 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
LIMS1-208ENST00000428064 SCYL2Q6P3W7 929 aa21.26■□□□□ 0.99
LIMS1-208ENST00000428064 LEKR1Q6ZMV7 388 aa21.26■□□□□ 0.99
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF354CQ86Y25 554 aa21.26■□□□□ 0.99
LIMS1-208ENST00000428064 HCAR2Q8TDS4 363 aa21.26■□□□□ 0.99
LIMS1-208ENST00000428064 BTN2A2Q8WVV5 523 aa21.26■□□□□ 0.99
LIMS1-208ENST00000428064 HMCESQ96FZ2 354 aa21.26■□□□□ 0.99
LIMS1-208ENST00000428064 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
LIMS1-208ENST00000428064 IGSF10Q6WRI0 2623 aa21.26■□□□□ 0.99
LIMS1-208ENST00000428064 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
LIMS1-208ENST00000428064 RASA4BC9J798 803 aa21.25■□□□□ 0.99
LIMS1-208ENST00000428064 TPP1O14773 563 aa21.25■□□□□ 0.99
LIMS1-208ENST00000428064 RASA4O43374 803 aa21.25■□□□□ 0.99
LIMS1-208ENST00000428064 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
LIMS1-208ENST00000428064 CREB3O43889 395 aa21.25■□□□□ 0.99
LIMS1-208ENST00000428064 MBD3O95983 291 aa21.25■□□□□ 0.99
LIMS1-208ENST00000428064 RHOAP61586 193 aa21.25■□□□□ 0.99
LIMS1-208ENST00000428064 SEMG2Q02383 582 aa21.25■□□□□ 0.99
LIMS1-208ENST00000428064 PTK2BQ14289 1009 aa21.25■□□□□ 0.99
LIMS1-208ENST00000428064 GRM3Q14832 879 aa21.25■□□□□ 0.99
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF542PQ5EBM4 170 aa21.25■□□□□ 0.99
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC183Q5T5S1 534 aa21.25■□□□□ 0.99
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