RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384540.1

RNU6-601P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 601, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-601P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-601P-201ENST00000384540 GAGE7O76087 117 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-601P-201ENST00000384540 CSTBP04080 98 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-601P-201ENST00000384540 GAGE12FP0CL80 117 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-601P-201ENST00000384540 GAGE12GP0CL81 117 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-601P-201ENST00000384540 GAGE12IP0CL82 117 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-601P-201ENST00000384540 CST5P28325 142 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-601P-201ENST00000384540 HTR3AP46098 478 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-601P-201ENST00000384540 CENPAP49450 140 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-601P-201ENST00000384540 ECT2LQ008S8 904 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC18A2Q05940 514 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-601P-201ENST00000384540 DDR1Q08345 913 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-601P-201ENST00000384540 ACSM2AQ08AH3 577 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-601P-201ENST00000384540 GAGE1Q13065 139 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-601P-201ENST00000384540 GAGE4Q13068 117 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-601P-201ENST00000384540 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-601P-201ENST00000384540 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-601P-201ENST00000384540 IL13RA2Q14627 380 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-601P-201ENST00000384540 LPIN1Q14693 890 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-601P-201ENST00000384540 ME3Q16798 604 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-601P-201ENST00000384540 FBXL22Q6P050 247 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-601P-201ENST00000384540 RHBDF2Q6PJF5 856 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-601P-201ENST00000384540 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-601P-201ENST00000384540 DENND6AQ8IWF6 608 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-601P-201ENST00000384540 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-601P-201ENST00000384540 POC1AQ8NBT0 407 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-601P-201ENST00000384540 OR6Y1Q8NGX8 325 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-601P-201ENST00000384540 TMEM255BQ8WV15 326 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-601P-201ENST00000384540 TRIB2Q92519 343 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-601P-201ENST00000384540 CRB3Q9BUF7 120 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF700Q9H0M5 742 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-601P-201ENST00000384540 SDF2L1Q9HCN8 221 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-601P-201ENST00000384540 NLKQ9UBE8 527 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-601P-201ENST00000384540 HDAC6Q9UBN7 1215 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-601P-201ENST00000384540 MALT1Q9UDY8 824 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-601P-201ENST00000384540 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 VNN2O95498 520 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 SERPINC1P01008 464 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 CGAP01215 116 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 IL1AP01583 271 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 AFPP02771 609 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 TNNT1P13805 278 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 AMD1P17707 334 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 ANOS1P23352 680 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 PTPN9P43378 593 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 GLIPR1P48060 266 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 PRKAA2P54646 552 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 CYP4A11Q02928 519 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 BLMHQ13867 455 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 CALCRLQ16602 461 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF484Q5JVG2 852 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 C9orf139Q6ZV77 190 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 SFTPA2Q8IWL1 248 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 PGBD5Q8N414 524 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 ANKRD44Q8N8A2 993 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 SPATA20Q8TB22 786 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 TMEM170AQ8WVE7 144 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 SECTM1Q8WVN6 248 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 SORCS1Q8WY21 1168 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 SDCCAG3Q96C92 435 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 RNF183Q96D59 192 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 SCMH1Q96GD3 660 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 EVA1AQ9H8M9 152 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 UBTD1Q9HAC8 227 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 EBF2Q9HAK2 575 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 ANKRD10Q9NXR5 420 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 OR6C3Q9NZP0 311 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 NOTCH3Q9UM47 2321 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 CPED1A4D0V7 1026 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 HMX3A6NHT5 357 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 J3KR12 359 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 WNT9BO14905 357 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 CLGNO14967 610 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 PLIN1O60240 522 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 PMS2P2O95744 297 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 ADAP00813 363 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 DGKAP23743 735 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 TTKP33981 857 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 ARSFP54793 590 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 ARL16Q0P5N6 197 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 TROAPQ12815 778 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 TUBA1AQ71U36 451 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 MON1AQ86VX9 555 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 CCDC105Q8IYK2 499 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 THAP4Q8WY91 577 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 GOLGA1Q92805 767 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 WBP2Q969T9 261 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 MTBPQ96DY7 904 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 MASTLQ96GX5 879 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 LRFN5Q96NI6 719 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 UHRF2Q96PU4 802 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 OR1F2PQ96R84 312 aa2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.7 ms