RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384479.1

RNU6-790P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 790, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-790P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-790P-201ENST00000384479 NAA35Q5VZE5 725 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 C17orf99Q6UX52 265 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 PRSS45Q7RTY3 260 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 PALB2Q86YC2 1186 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 C2CD5Q86YS7 1000 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 SFTPA2Q8IWL1 248 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 TCP11L2Q8N4U5 519 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 CEP70Q8NHQ1 597 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 HERVK_113Q902F9 699 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 HSPH1Q92598 858 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 RILPL2Q969X0 211 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 RNF183Q96D59 192 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 REEP2Q9BRK0 252 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 IL25Q9H293 177 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 TAOK3Q9H2K8 898 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 ZNF556Q9HAH1 456 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 ITM2CQ9NQX7 267 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 GPR52Q9Y2T5 361 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 A0A1B0GVM2 712 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 CPED1A4D0V7 1026 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 ANP32CO43423 234 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 KCNJ13O60928 360 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 NBNO60934 754 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 CKMT1AP12532 417 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 FMO4P31512 558 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 PTPN9P43378 593 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 TUBA1BP68363 451 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 BNC1Q01954 994 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 MYBPC2Q14324 1141 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 HLFQ16534 295 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 C9orf57Q5W0N0 161 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 KLHL24Q6TFL4 600 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 IL20RBQ6UXL0 311 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 C16orf82Q7Z2V1 217 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 CPXM2Q8N436 756 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 SPATA3Q8NHX4 192 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 OTULINQ96BN8 352 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 RTP4Q96DX8 246 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 CD180Q99467 661 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 LMAN2LQ9H0V9 348 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 A0A0U1RQF3 1178 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 ARHGAP10A1A4S6 786 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 GAGE10A6NGK3 116 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 ITM2AO43736 263 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 PIP5K1CO60331 668 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 CBX6O95503 412 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 WEE2P0C1S8 567 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 RXRAP19793 462 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 ITGAXP20702 1163 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 CHATP28329 748 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 HALP42357 657 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 TMPRSS3P57727 454 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 VAMP2P63027 116 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 CHRNDQ07001 517 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 NFATC4Q14934 902 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 PLCB4Q15147 1175 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 TAF5Q15542 800 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 KIF19Q2TAC6 998 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 FAM69BQ5VUD6 431 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 CREB3L2Q70SY1 520 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 GHDCQ8N2G8 530 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 AADATQ8N5Z0 425 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 RFWD2Q8NHY2 731 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 GPT2Q8TD30 523 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 COG8Q96MW5 612 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 LRFN5Q96NI6 719 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 DUX5Q96PT3 197 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 FIZ1Q96SL8 496 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 LHPPQ9H008 270 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 EPHX3Q9H6B9 360 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 GAREM1Q9H706 876 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 TMEM160Q9NX00 188 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 NDRG3Q9UGV2 375 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 KCNG2Q9UJ96 466 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 DYTNA2CJ06 578 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 PEX12O00623 359 aa2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.8 ms