RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285199.11

USP43-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 43, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP43, Length 4,169 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43-201ENST00000285199 WSCD1Q658N2 575 aa15.85■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 SFRP1Q8N474 314 aa15.85■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 ZFP28Q8NHY6 868 aa15.85■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 CLEC4DQ8WXI8 215 aa15.85■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 IL22Q9GZX6 179 aa15.85■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 ZFP14Q9HCL3 533 aa15.85■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 TRAF6Q9Y4K3 522 aa15.85■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 A0A0J9YYE9 177 aa15.85■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 FFAR3O14843 346 aa15.85■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 GPR42O15529 346 aa15.85■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 GLP2RO95838 553 aa15.85■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 CCT8P50990 548 aa15.85■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 PGAM4Q8N0Y7 254 aa15.85■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 ZNF276Q8N554 614 aa15.85■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 PHC3Q8NDX5 983 aa15.85■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 CHST13Q8NET6 341 aa15.85■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 ASB7Q9H672 318 aa15.85■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 GIMAP2Q9UG22 337 aa15.85■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 RAB26Q9ULW5 256 aa15.85■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 EFR3BQ9Y2G0 817 aa15.85■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa15.85■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 C2CD4BA6NLJ0 364 aa15.85■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 NADKO95544 446 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 JAK1P23458 1154 aa15.85■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 NDUFV1P49821 464 aa15.85■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 XIAPP98170 497 aa15.85■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 SLC18A2Q05940 514 aa15.85■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 EFEMP1Q12805 493 aa15.85■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 MYLK3Q32MK0 819 aa15.85■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 PNPLA1Q8N8W4 532 aa15.85■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 ZFAND2BQ8WV99 257 aa15.85■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 WNT8BQ93098 351 aa15.85■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 KATNAL1Q9BW62 490 aa15.85■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 DPEP3Q9H4B8 488 aa15.85■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 IMPAD1Q9NX62 359 aa15.85■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 CACNG4Q9UBN1 327 aa15.85■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 MAGEB16A2A368 324 aa15.84■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 E7ENX8 843 aa15.84■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 STX7O15400 261 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 H6PDO95479 791 aa15.84■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 ATP6V1E1P36543 226 aa15.84■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 C6orf183Q5T699 404 aa15.84■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 TMEM26Q6ZUK4 368 aa15.84■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 KLHL5Q96PQ7 755 aa15.84■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 PEBP4Q96S96 227 aa15.84■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 TBL1YQ9BQ87 522 aa15.84■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 PCDH12Q9NPG4 1184 aa15.84■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 MORF4L1Q9UBU8 362 aa15.84■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 TRIM43BA6NCK2 446 aa15.84■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 TMEM247A6NEH6 219 aa15.84■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 IRF1P10914 325 aa15.84■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 BDNFP23560 247 aa15.84■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 CRABP2P29373 138 aa15.84■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 HPCAP84074 193 aa15.84■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 ZBED2Q9BTP6 218 aa15.84■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa15.84■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 TRIM39Q9HCM9 518 aa15.84■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 MPP6Q9NZW5 540 aa15.84■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 COQ6Q9Y2Z9 468 aa15.84■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 ATP8B3O60423 1300 aa15.84■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 C10orf120Q5SQS8 335 aa15.84■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 ANKS6Q68DC2 871 aa15.84■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 SH3GL1Q99961 368 aa15.84■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 OSBPL6Q9BZF3 934 aa15.84■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 TMEM134Q9H6X4 195 aa15.84■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 FANCEQ9HB96 536 aa15.84■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa15.84■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 EVPLLA8MZ36 301 aa15.83■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 H3BMM5 538 aa15.83■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 CILPO75339 1184 aa15.83■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 XPAP23025 273 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 GK3PQ14409 553 aa15.83■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 MARC1Q5VT66 337 aa15.83■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 GCNT7Q6ZNI0 430 aa15.83■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 GALNT5Q7Z7M9 940 aa15.83■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 VPS33AQ96AX1 596 aa15.83■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 TMIGD2Q96BF3 282 aa15.83■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 EXOC2Q96KP1 924 aa15.83■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 GPR63Q9BZJ6 419 aa15.83■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 HMG20AQ9NP66 347 aa15.83■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa15.83■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 WDR70Q9NW82 654 aa15.83■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 EURLQ9NYK6 297 aa15.83■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 WWOXQ9NZC7 414 aa15.83■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 ARHGEF9O43307 516 aa15.83■□□□□ 0.12
USP43-201ENST00000285199 FAM20BO75063 409 aa15.83■□□□□ 0.12
USP43-201ENST00000285199 RPL10P27635 214 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms