RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM25Q86YD3 366 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC25A41Q8N5S1 370 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP9.46□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 LRRC3BQ96PB8 259 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 LINC00597Q9H2U6 94 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 VPS28Q9UK41 221 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 TYROBPO43914 113 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 SPAG7O75391 227 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 PCID2Q5JVF3 399 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 SIRPB2Q5JXA9 342 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 PKN3Q6P5Z2 889 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 RNF135Q8IUD6 432 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 DPP7Q9UHL4 492 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 IKBKGQ9Y6K9 419 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 F7P08709 466 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 ARNTP27540 789 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 CD70P32970 193 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 LMAN2Q12907 356 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 MICALCLQ6ZW33 695 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 FIBINQ8TAL6 211 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 CENPTQ96BT3 561 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 TRIB3Q96RU7 358 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 AGAP2Q99490 1192 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 KCNK9Q9NPC2 374 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 SENP1Q9P0U3 644 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 CDH22Q9UJ99 828 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 GOLGA8RI6L899 631 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 K7ERQ8 282 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 TMCC1O94876 653 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 MGAT5Q09328 741 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 USP4Q13107 963 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 BMPR2Q13873 1038 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 LRRC14Q15048 493 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF449Q6P9G9 518 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 DCAF4L2Q8NA75 395 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 DENND1AQ8TEH3 1009 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 MLXIPLQ9NP71 852 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 TREX1Q9NSU2 369 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 LHX3Q9UBR4 397 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 PRKAG3Q9UGI9 489 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 TCAF1Q9Y4C2 921 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 TRIM49D1C9J1S8 452 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP9.44□□□□□ -0.95e-6■□□□□ 8.1
RABGEF1-201ENST00000284957 HLA-FP30511 346 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 SCNN1BP51168 640 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 SEC24CP53992 1094 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 RSPRY1Q96DX4 576 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 SMC6Q96SB8 1091 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 LMAN2LQ9H0V9 348 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC28A3Q9HAS3 691 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 MSRAQ9UJ68 235 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 A6NNZ2 444 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 GOLGA8TH3BQL2 631 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF197O14709 1029 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 INSIG1O15503 277 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 RFPL1O75677 317 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 GLP2RO95838 553 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 PENKP01210 267 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 PRLP01236 227 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 SERPINF2P08697 491 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 WDR4P57081 412 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 CDK18Q07002 472 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 TUBB8Q3ZCM7 444 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 PACS1Q6VY07 963 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 ANKRD42Q8N9B4 389 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 BANPQ8N9N5 519 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 MGARPQ8TDB4 240 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 FEM1CQ96JP0 617 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 MCMBPQ9BTE3 642 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 RABEP2Q9H5N1 569 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 ZFATQ9P243 1243 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM47DPA6NHR8 397 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 EPOP01588 193 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 PRKCGP05129 697 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 TCF3P15923 654 aa9.44□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.3 ms