RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259351.9

RALGPS1-201, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RALGPS1, Length 6,336 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-201ENST00000259351 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa13□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa13□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa13□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 MYL12BO14950 172 aa13□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 LINC00032P0C843 101 aa13□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 ARHGAP8P85298 464 aa13□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 FAM187BQ17R55 369 aa13□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 USP45Q70EL2 814 aa13□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 STK40Q8N2I9 435 aa13□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 PHACTR1Q9C0D0 580 aa13□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 ZYG11BQ9C0D3 744 aa13□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 NUDT14O95848 222 aa13□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 CATP04040 527 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 CHN2P52757 468 aa13□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 DDI2Q5TDH0 399 aa13□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 FAM45AQ8TCE6 357 aa13□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 UBASH3BQ8TF42 649 aa13□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 PCDH18Q9HCL0 1135 aa13□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 TMEM191CA6NGB0 347 aa12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 MAP3K13O43283 966 aa12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 MYL12AP19105 171 aa12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 HDCP19113 662 aa12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 HPCAL1P37235 193 aa12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 MATKP42679 507 aa12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 BRCC3P46736 316 aa12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 CCR4P51679 360 aa12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 CLCN5P51795 746 aa12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 TRAF3Q13114 568 aa12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 PDK3Q15120 406 aa12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 PPM1LQ5SGD2 360 aa12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 C11orf88Q6PI97 169 aa12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 PACS1Q6VY07 963 aa12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 NEK10Q6ZWH5 1172 aa12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 DHDDSQ86SQ9 333 aa12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 GPR156Q8NFN8 814 aa12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 SLC4A5Q9BY07 1137 aa12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 MORF4L1Q9UBU8 362 aa12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 NDOR1Q9UHB4 597 aa12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 CDH9Q9ULB4 789 aa12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 UMPSP11172 480 aa12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 VAV1P15498 845 aa12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 CD52P31358 61 aa12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 MARSP56192 900 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 SPANXN2Q5MJ10 180 aa12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 HECTD3Q5T447 861 aa12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 HGSNATQ68CP4 663 aa12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 CPXM1Q96SM3 734 aa12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 SPAG4Q9NPE6 437 aa12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 PCDH12Q9NPG4 1184 aa12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 EDF1O60869 148 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 ULK1O75385 1050 aa12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 FYNP06241 537 aa12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 ITGADQ13349 1161 aa12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 HSDL1Q3SXM5 330 aa12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 UTS2BQ765I0 119 aa12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 ADHFE1Q8IWW8 467 aa12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 GSTCDQ8NEC7 633 aa12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 MFSD14AQ96MC6 490 aa12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 SALL4Q9UJQ4 1053 aa12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 ULK2Q8IYT8 1036 aa12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 SORCS3Q9UPU3 1222 aa12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 RAP2CQ9Y3L5 183 aa12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 ANKDD1BA6NHY2 528 aa12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 CNPP09543 421 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 PIK3CGP48736 1102 aa12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 ST13P50502 369 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 SQLEQ14534 574 aa12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 ARCQ7LC44 396 aa12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 OR6K2Q8NGY2 324 aa12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 SOCS4Q8WXH5 440 aa12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa12.99□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms