RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 SNNO75324 88 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 ZBED1O96006 694 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 CKMP06732 381 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 CD48P09326 243 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 ANPEPP15144 967 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 TGM2P21980 687 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 CRHR1P34998 444 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 PDK2Q15119 407 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 IER5LQ5T953 404 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 NUDCD3Q8IVD9 361 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 CPXM1Q96SM3 734 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 COMMD8Q9NX08 183 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 H3BRJ5 948 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 MDM4O15151 490 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 CRABP2P29373 138 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 AVPR1AP37288 418 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 TEX44Q53QW1 395 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 PM20D1Q6GTS8 502 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 TTC7BQ86TV6 843 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 PPM1NQ8N819 430 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 CNPY3Q9BT09 278 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC106Q9BWC9 280 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 TRPV4Q9HBA0 871 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 SMPD4Q9NXE4 827 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 NDE1Q9NXR1 346 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 IGSF9Q9P2J2 1179 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 E5RJQ4 531 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 TIFABQ6ZNK6 161 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 CYS1Q717R9 158 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 CTAGE3PQ8IX95 158 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 ULK2Q8IYT8 1036 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 DTX3LQ8TDB6 740 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 HSPH1Q92598 858 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC4A5Q9BY07 1137 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 VCX3BQ9H321 246 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 POPDC2Q9HBU9 364 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 TECTAO75443 2155 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 RFPL1O75677 317 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 PIAS1O75925 651 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 APOEP02649 317 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 AOC1P19801 751 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 RPL34P49207 117 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 TDGQ13569 410 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 MTSS1LQ765P7 747 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 PDZD8Q8NEN9 1154 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 OVCA2Q8WZ82 227 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 ELSPBP1Q96BH3 223 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 ZFYVE19Q96K21 471 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 RAB6BQ9NRW1 208 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 TDP1Q9NUW8 608 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 THAP1Q9NVV9 213 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 PCSK1NQ9UHG2 260 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKRD33BA6NCL7 494 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 H7C0C1 242 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 TLR5O60602 858 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 ENO1P06733 434 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP5OP48047 213 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 XIAPP98170 497 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 WBP2Q969T9 261 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 CFAP36Q96G28 342 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 HSFY1Q96LI6 401 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 GBP5Q96PP8 586 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 USP29Q9HBJ7 922 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 GKN1Q9NS71 199 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 ARMCX1Q9P291 453 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF487B1APH4 448 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 TNFRSF10AO00220 468 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 ECI2O75521 394 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 OLFM2O95897 454 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 BPGMP07738 259 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP3CCP48454 512 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 DAOAP59103 153 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 COL4A3Q01955 1670 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 CHI3L2Q15782 390 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 HECTD3Q5T447 861 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF157Q96PX1 679 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 EPHX3Q9H6B9 360 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 ERBB2P04626 1255 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-201ENST00000246533 AMPD1P23109 780 aa26.68■■□□□ 1.86
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