RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 DENND6AQ8IWF6 608 aa22.38■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 IRGQQ8WZA9 623 aa22.38■■□□□ 1.17
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HTATSF1-201ENST00000218364 ADA2Q9NZK5 511 aa22.38■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 THEGQ9P2T0 379 aa22.38■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC78A2IDD5 438 aa22.38■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 C7orf72A4D263 438 aa22.38■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 RRN3P2A6NIE6 340 aa22.38■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 GABRDO14764 452 aa22.38■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 TRIM24O15164 1050 aa22.38■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM200BP0CF97 657 aa22.38■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 MPP1Q00013 466 aa22.38■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
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HTATSF1-201ENST00000218364 MAPRE2Q15555 327 aa22.38■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 HMGCLL1Q8TB92 370 aa22.38■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 EME1Q96AY2 570 aa22.38■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 OMDQ99983 421 aa22.38■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 MED10Q9BTT4 135 aa22.38■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 RNF39Q9H2S5 420 aa22.38■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 CNGB3Q9NQW8 809 aa22.38■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 DDIT4Q9NX09 232 aa22.38■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 RRN3Q9NYV6 651 aa22.38■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 RNF11Q9Y3C5 154 aa22.38■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 A0A087X1B8 175 aa22.38■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 CTBP1Q13363 440 aa22.38■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 KIAA0319Q5VV43 1072 aa22.38■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 CNSTQ6PJW8 725 aa22.38■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 TRIM67Q6ZTA4 783 aa22.38■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 SPPL2BQ8TCT7 592 aa22.38■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 FAR2Q96K12 515 aa22.38■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa22.38■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 CEPT1Q9Y6K0 416 aa22.38■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 E7ENX8 843 aa22.37■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 F9P00740 461 aa22.37■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 MMP3P08254 477 aa22.37■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 ARNTP27540 789 aa22.37■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 DGKDQ16760 1214 aa22.37■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 TBC1D25Q3MII6 688 aa22.37■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 TBL1YQ9BQ87 522 aa22.37■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 FTHL17Q9BXU8 183 aa22.37■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 HACD3Q9P035 362 aa22.37■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 OR12D3Q9UGF7 316 aa22.37■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 NCAM1P13591 858 aa22.37■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 CXCR3P49682 368 aa22.37■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 SULT2A1Q06520 285 aa22.37■■□□□ 1.17
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HTATSF1-201ENST00000218364 SQLEQ14534 574 aa22.37■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 PM20D1Q6GTS8 502 aa22.37■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 HAUS8Q9BT25 410 aa22.37■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 OSBPL11Q9BXB4 747 aa22.37■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 OSBPL2Q9H1P3 480 aa22.37■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 POMKQ9H5K3 350 aa22.37■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 COQ10BQ9H8M1 238 aa22.37■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa22.37■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 SNX10Q9Y5X0 201 aa22.37■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 ADM5C9JUS6 153 aa22.36■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 LRIG2O94898 1065 aa22.36■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 COG7P83436 770 aa22.36■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 PPIL2Q13356 520 aa22.36■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 PSMD5Q16401 504 aa22.36■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 RAB41Q5JT25 222 aa22.36■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 DENND5AQ6IQ26 1287 aa22.36■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 PAOXQ6QHF9 649 aa22.36■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 AMIGO2Q86SJ2 522 aa22.36■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 MEAF6Q9HAF1 191 aa22.36■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF236Q9UL36 1845 aa22.36■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC5A2P31639 672 aa22.36■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 TAS2R39P59534 338 aa22.36■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 UBXN11Q5T124 520 aa22.36■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 WSCD1Q658N2 575 aa22.36■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 CARM1Q86X55 608 aa22.36■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa22.36■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 SPATA6LQ8N4H0 392 aa22.36■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 HEXDCQ8WVB3 486 aa22.36■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 FCRL5Q96RD9 977 aa22.36■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 SMOQ99835 787 aa22.36■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 WDCPQ9H6R7 721 aa22.36■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa22.35■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 FBP2O00757 339 aa22.35■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF23P17027 643 aa22.35■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 LRPAP1P30533 357 aa22.35■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 USP46P62068 366 aa22.35■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 HPCAP84074 193 aa22.35■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
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