RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640634.1

SCARB2-222, Transcript of scavenger receptor class B member 2, human

TSL 5

Gene SCARB2, Length 1,734 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCARB2-222	ENST00000640634	OLFM3	Q96PB7	478 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	FAM129B	Q96TA1	746 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	UBA2	Q9UBT2	640 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634		R4GN57	208 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	KCNK1	O00180	336 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	APBB3	O95704	486 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	PSMD8	P48556	350 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	MAX	P61244	160 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	RPS14	P62263	151 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	IL10RB	Q08334	325 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	ZBTB17	Q13105	803 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	BBS12	Q6ZW61	710 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	RASSF3	Q86WH2	238 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	VSIG1	Q86XK7	387 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	PGBD3	Q8N328	593 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	CCNY	Q8ND76	341 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	OR2T3	Q8NH03	318 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	NPC1	O15118	1278 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	PTPN7	P35236	360 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	NNMT	P40261	264 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	RHOA	P61586	193 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	DAB2	P98082	770 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	IHH	Q14623	411 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	FAM124A	Q86V42	546 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	KDM1B	Q8NB78	822 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	ACTL9	Q8TC94	416 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	ZDHHC6	Q9H6R6	413 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634		F5H423	210 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	MID1	O15344	667 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	KIF5C	O60282	957 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	PIGN	O95427	931 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	IL1B	P01584	269 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	BCKDHB	P21953	392 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	GNAL	P38405	381 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	CLCN6	P51797	869 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	GNG11	P61952	73 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	AP1B1	Q10567	949 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	TFDP2	Q14188	446 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	CARD16	Q5EG05	197 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	LRRC73	Q5JTD7	316 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	COG1	Q8WTW3	980 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	HDAC11	Q96DB2	347 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	MS4A14	Q96JA4	679 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	ZSCAN5C	A6NGD5	496 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	KRIT1	O00522	736 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	AXIN1	O15169	862 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	ZNF185	O15231	689 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	HR	O43593	1189 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	LEFTY1	O75610	366 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	APOC2	P02655	101 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	HLA-DQB2	P05538	268 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	TGM2	P21980	687 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	COPS2	P61201	443 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	SLC20A2	Q08357	652 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	NOMO1	Q15155	1222 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	CST6	Q15828	149 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	ARSI	Q5FYB1	569 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	DEFB119	Q8N690	84 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	CNTD1	Q8N815	330 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	OR2AP1	Q8NGE2	309 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	P3H4	Q92791	437 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	NELL1	Q92832	810 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	ARRDC3	Q96B67	414 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
SCARB2-222	ENST00000640634	CEP44	Q9C0F1	390 aa		11.09	□□□□□ -0.63

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