RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616768.4

MLH1-223, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2

Gene MLH1, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-223	ENST00000616768	TMOD1	P28289	359 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MLH1-223	ENST00000616768	ACADVL	P49748	655 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MLH1-223	ENST00000616768	SLC26A2	P50443	739 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MLH1-223	ENST00000616768	STAT4	Q14765	748 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MLH1-223	ENST00000616768	CLCA4	Q14CN2	919 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MLH1-223	ENST00000616768	ADRM1	Q16186	407 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MLH1-223	ENST00000616768	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MLH1-223	ENST00000616768	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MLH1-223	ENST00000616768	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MLH1-223	ENST00000616768	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MLH1-223	ENST00000616768	RTL10	Q7L3V2	364 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MLH1-223	ENST00000616768	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MLH1-223	ENST00000616768	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MLH1-223	ENST00000616768	OR7D4	Q8NG98	312 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MLH1-223	ENST00000616768	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MLH1-223	ENST00000616768	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
MLH1-223	ENST00000616768	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
MLH1-223	ENST00000616768	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
MLH1-223	ENST00000616768	SDF4	Q9BRK5	362 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MLH1-223	ENST00000616768	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MLH1-223	ENST00000616768	GPR88	Q9GZN0	384 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MLH1-223	ENST00000616768	DCTPP1	Q9H773	170 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MLH1-223	ENST00000616768	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MLH1-223	ENST00000616768	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MLH1-223	ENST00000616768	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MLH1-223	ENST00000616768	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MLH1-223	ENST00000616768	ANK1	P16157	1881 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MLH1-223	ENST00000616768	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
MLH1-223	ENST00000616768	RTTN	Q86VV8	2226 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768		I3L4J1	428 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768		K7EQS6	105 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	ZBTB5	O15062	677 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	RAMP2	O60895	175 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	NADK	O95544	446 aa	Predicted RBP	5.27	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	ABHD16A	O95870	558 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	CCNE2	O96020	404 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	KRT7	P08729	469 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	SREBF1	P36956	1147 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	CYP4F2	P78329	520 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	SP140	Q13342	867 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	5.27	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	5.27	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	5.27	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	LAYN	Q6UX15	382 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	5.27	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	UBR7	Q8N806	425 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	5.27	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	PIGS	Q96S52	555 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	ASCL3	Q9NQ33	180 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	DONSON	Q9NYP3	566 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	TBX20	Q9UMR3	447 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	IPP	Q9Y573	584 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	5.27	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	5.27	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	ATR	Q13535	2644 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	MAGEB2	O15479	319 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	ORC4	O43929	436 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	NDUFS2	O75306	463 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	HMMR	O75330	724 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	LDOC1	O95751	146 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	IGHD	P01880	384 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	GABRG2	P18507	467 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	AKAP5	P24588	427 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	KIF5B	P33176	963 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	CCT8	P50990	548 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	MLLT10	P55197	1068 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	COL10A1	Q03692	680 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	KIF19	Q2TAC6	998 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	EMC10	Q5UCC4	262 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		5.26	□□□□□ -1.57

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms