RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589649.1

TOMM40-205, Transcript of translocase of outer mitochondrial membrane 40, humanhuman

TSL 2

Gene TOMM40, Length 731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40-205ENST00000589649 RETREG1Q9H6L5 497 aa24.97■■□□□ 1.59
TOMM40-205ENST00000589649 SMTNL1A8MU46 457 aa24.96■■□□□ 1.59
TOMM40-205ENST00000589649 CCDC172P0C7W6 258 aa24.96■■□□□ 1.59
TOMM40-205ENST00000589649 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
TOMM40-205ENST00000589649 AKT2P31751 481 aa24.96■■□□□ 1.59
TOMM40-205ENST00000589649 ABL2P42684 1182 aa24.96■■□□□ 1.59
TOMM40-205ENST00000589649 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
TOMM40-205ENST00000589649 OR2AP1Q8NGE2 309 aa24.96■■□□□ 1.59
TOMM40-205ENST00000589649 CALN1Q9BXU9 219 aa24.96■■□□□ 1.59
TOMM40-205ENST00000589649 GGT7Q9UJ14 662 aa24.96■■□□□ 1.59
TOMM40-205ENST00000589649 ITM2BQ9Y287 266 aa24.96■■□□□ 1.59
TOMM40-205ENST00000589649 C16orf96A6NNT2 1141 aa24.95■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 RAD51BO15315 384 aa24.95■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 UGT2B4P06133 528 aa24.95■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 MAMLD1Q13495 774 aa24.95■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 MYLK3Q32MK0 819 aa24.95■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 TMC6Q7Z403 805 aa24.95■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 PROSER1Q86XN7 944 aa24.95■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 HMCESQ96FZ2 354 aa24.95■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 SLC17A9Q9BYT1 436 aa24.95■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 HAUS4Q9H6D7 363 aa24.95■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 ZZEF1O43149 2961 aa24.94■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 TMCC1O94876 653 aa24.94■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 GSRP00390 522 aa24.94■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 ZNF165P49910 485 aa24.94■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 ASIC2Q16515 512 aa24.94■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 ZNF542PQ5EBM4 170 aa24.94■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 LRRC73Q5JTD7 316 aa24.94■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 KDM7AQ6ZMT4 941 aa24.94■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 PLPP6Q8IY26 295 aa24.94■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa24.94■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 GALNT15Q8N3T1 639 aa24.94■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 SLC25A45Q8N413 288 aa24.94■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 FEM1CQ96JP0 617 aa24.94■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 BMFQ96LC9 184 aa24.94■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 KLHL32Q96NJ5 620 aa24.94■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 UCKL1Q9NWZ5 548 aa24.94■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 MYO6Q9UM54 1294 aa24.94■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa24.93■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 RASA4BC9J798 803 aa24.93■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 TRIM38O00635 465 aa24.93■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 RASA4O43374 803 aa24.93■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 ACADVLP49748 655 aa24.93■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 RPS21P63220 83 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 CA9Q16790 459 aa24.93■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 FILIP1LQ4L180 1135 aa24.93■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 ZNF805Q5CZA5 627 aa24.93■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 Q6ZSR6 202 aa24.93■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa24.93■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 TSC1Q92574 1164 aa24.93■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 EPAS1Q99814 870 aa24.93■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 TRIM7Q9C029 511 aa24.93■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 KLHL11Q9NVR0 708 aa24.93■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 CHD5Q8TDI0 1954 aa24.93■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 POM121BA6NF01 834 aa24.92■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 TRABD2BA6NFA1 517 aa24.92■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 IGLON5A6NGN9 336 aa24.92■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 SPINT1O43278 529 aa24.92■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 RFPL3O75679 317 aa24.92■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 POP4O95707 220 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 SKILP12757 684 aa24.92■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 ITIH2P19823 946 aa24.92■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 PSMA2P25787 234 aa24.92■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 CAMK2BQ13554 666 aa24.92■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa24.92■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa24.92■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa24.92■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 PARVAQ9NVD7 372 aa24.92■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 PCSK1NQ9UHG2 260 aa24.92■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 A0A1B0GTH6 734 aa24.91■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 WASH4PA8MWX3 477 aa24.91■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 INSIG1O15503 277 aa24.91■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 SIGLEC6O43699 453 aa24.91■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 AP1G1O43747 822 aa24.91■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 DGKAP23743 735 aa24.91■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 RHOAP61586 193 aa24.91■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 SERINC3Q13530 473 aa24.91■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 IQCB1Q15051 598 aa24.91■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 GDPD4Q6W3E5 623 aa24.91■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 LRIG1Q96JA1 1093 aa24.91■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 VCPIP1Q96JH7 1222 aa24.91■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 PEBP4Q96S96 227 aa24.91■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 FUCA2Q9BTY2 467 aa24.91■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa24.91■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 AP4E1Q9UPM8 1137 aa24.91■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa24.91■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa24.91■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa24.91■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 A6NNZ2 444 aa24.9■■□□□ 1.58
TOMM40-205ENST00000589649 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP24.9■■□□□ 1.582e-18■■■■□ 23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms