RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559		H3BNX3	289 aa		18.64	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	DLX3	O60479	287 aa		18.64	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	MAFK	O60675	156 aa		18.64	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		18.64	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	18.64	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	BDNF	P23560	247 aa		18.64	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	PEX2	P28328	305 aa		18.64	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	18.64	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		18.64	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	LPCAT4	Q643R3	524 aa		18.64	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	18.64	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		18.64	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		18.64	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	PTPN18	Q99952	460 aa		18.64	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	FICD	Q9BVA6	458 aa		18.64	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		18.64	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		18.64	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	MIOS	Q9NXC5	875 aa		18.64	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		18.64	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	NEU3	Q9UQ49	428 aa		18.64	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC78	A2IDD5	438 aa		18.64	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		18.64	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	KIF3C	O14782	793 aa		18.64	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	IRAK2	O43187	625 aa		18.64	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	18.64	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	CYP11A1	P05108	521 aa		18.64	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	VCL	P18206	1134 aa		18.64	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	CCR1	P32246	355 aa		18.64	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	ADRA1A	P35348	466 aa		18.64	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	AVPR1A	P37288	418 aa		18.64	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	CD151	P48509	253 aa		18.64	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	18.64	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	SCNN1G	P51170	649 aa		18.64	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	SLC12A2	P55011	1212 aa		18.64	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	DNAJB13	P59910	316 aa		18.64	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	POU4F1	Q01851	419 aa		18.64	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	SFT2D3	Q587I9	215 aa		18.64	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	SPRYD7	Q5W111	196 aa		18.64	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	18.64	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		18.64	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		18.64	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	PGAM4	Q8N0Y7	254 aa		18.64	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	GPR78	Q96P69	363 aa		18.64	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		18.64	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		18.64	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		18.64	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		18.64	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	18.64	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	KPNA6	O60684	536 aa		18.63	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	18.63	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	18.63	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	18.63	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	CTBP1	Q13363	440 aa		18.63	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	18.63	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	MMEL1	Q495T6	779 aa		18.63	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	18.63	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	NXN	Q6DKJ4	435 aa		18.63	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	18.63	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		18.63	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	LSMEM2	Q8N112	164 aa		18.63	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		18.63	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	18.63	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC126	Q96EE4	140 aa		18.63	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	CENPK	Q9BS16	269 aa		18.63	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		18.63	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	PGK1	P00558	417 aa		18.62	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	AQP4	P55087	323 aa		18.62	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	MPP1	Q00013	466 aa		18.62	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	SATB1	Q01826	763 aa		18.62	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	ART3	Q13508	389 aa		18.62	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	PIGG	Q5H8A4	983 aa		18.62	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		18.62	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		18.62	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	18.62	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		18.62	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		18.62	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	18.62	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	PHC3	Q8NDX5	983 aa		18.62	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		18.62	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	18.62	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	LPP	Q93052	612 aa		18.62	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	NXNL1	Q96CM4	212 aa		18.62	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	FAR2	Q96K12	515 aa		18.62	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	CDRT15	Q96T59	188 aa		18.62	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	SPON1	Q9HCB6	807 aa		18.62	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	TREX1	Q9NSU2	369 aa		18.62	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		18.62	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	FNIP2	Q9P278	1114 aa		18.62	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		18.62	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	GLTPD2	A6NH11	291 aa		18.62	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	PAGE1	O75459	146 aa		18.62	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	18.62	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	FLOT2	Q14254	428 aa		18.62	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		18.62	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		18.62	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		18.62	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	CEP97	Q8IW35	865 aa		18.62	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		18.62	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		18.62	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	CALML6	Q8TD86	181 aa		18.62	■□□□□ 0.57

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