RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557685.5

EFCAB11-213, Transcript of EF-hand calcium binding domain 11, human

TSL 3

Gene EFCAB11, Length 698 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFCAB11-213	ENST00000557685	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	SLC2A4	P14672	509 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	PTPN2	P17706	415 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	BSG	P35613	385 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	ARL3	P36405	182 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	ARHGAP25	P42331	645 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	GPR12	P47775	334 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	SLC18A2	Q05940	514 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	MAMLD1	Q13495	774 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	SPATA1	Q5VX52	437 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	SERPINA11	Q86U17	422 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	CNGA4	Q8IV77	575 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	ZNF333	Q96JL9	665 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	THSD1	Q9NS62	852 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685		A0A096LPK6	155 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	TTC36	A6NLP5	189 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	TIPRL	O75663	272 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	IRF1	P10914	325 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	ACADM	P11310	421 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	LAMP2	P13473	410 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	ZNF8	P17098	575 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	KEL	P23276	732 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	POU1F1	P28069	291 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	CD38	P28907	300 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	RGS2	P41220	211 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	GABRB2	P47870	512 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	PRKG2	Q13237	762 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	CCNG2	Q16589	344 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	CDC73	Q6P1J9	531 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	PXK	Q7Z7A4	578 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	GPAT4	Q86UL3	456 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	CNTROB	Q8N137	903 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	DDB2	Q92466	427 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	EME1	Q96AY2	570 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	TIGD1	Q96MW7	591 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	FSD2	A1L4K1	749 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	CBY3	A6NI87	242 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	LRRC53	A6NM62	1247 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	EBAG9	O00559	213 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	HSPB6	O14558	160 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	LDLRAD4	O15165	306 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	LDHC	P07864	332 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	MYZAP	P0CAP1	466 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	PRR35	P0CG20	571 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	ICAM3	P32942	547 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	TNFSF8	P32971	234 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	RYK	P34925	604 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	PTGER1	P34995	402 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	VEPH1	Q14D04	833 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	TXNDC8	Q6A555	127 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	BRINP3	Q76B58	766 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	ZNF575	Q86XF7	245 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	CADM3	Q8N126	398 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	KDM1B	Q8NB78	822 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFCAB11-213	ENST00000557685	NEK9	Q8TD19	979 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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