RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556591.1

CFAP54-208, Transcript of cilia and flagella associated protein 54, human

TSL 5

Gene CFAP54, Length 802 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CFAP54-208	ENST00000556591	PPM1E	Q8WY54	764 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	CATSPERB	Q9H7T0	1116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	CKAP5	Q14008	2032 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	EVPL	Q92817	2033 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	MS4A18	H0YCH9	400 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	EYA2	O00167	538 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	SPTLC2	O15270	562 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	SPRY3	O43610	288 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	LIAS	O43766	372 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	UROD	P06132	367 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	CTPS1	P17812	591 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	GPR12	P47775	334 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	TUB	P50607	506 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	CAPS	Q13938	189 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	HNF4G	Q14541	408 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	TEX45	Q8NA69	505 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	GPT2	Q8TD30	523 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	HTRA1	Q92743	480 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	TMEM18	Q96B42	140 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	PEMT	Q9UBM1	199 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	OR6C75	A6NL08	312 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	MMP3	P08254	477 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	GNLY	P22749	145 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	GGT5	P36269	586 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	CDH15	P55291	814 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	ABAT	P80404	500 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	MAPK7	Q13164	816 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	FSCB	Q5H9T9	825 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	TRIL	Q7L0X0	811 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	PALB2	Q86YC2	1186 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	ESX1	Q8N693	406 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	PLD5	Q8N7P1	536 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	YME1L1	Q96TA2	773 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	TEX22	C9J3V5	150 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	NPHP1	O15259	732 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	GUCY1B2	O75343	617 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	DCTD	P32321	178 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	TTK	P33981	857 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	GPD2	P43304	727 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	CENPA	P49450	140 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	CLCN5	P51795	746 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	VAMP2	P63027	116 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	GALNT2	Q10471	571 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	MYBPC2	Q14324	1141 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	LPIN1	Q14693	890 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	MON1B	Q7L1V2	547 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	TMEM163	Q8TC26	289 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	APOPT1	Q96IL0	206 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	FUZ	Q9BT04	418 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	DCLK3	Q9C098	648 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	PLK2	Q9NYY3	685 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	GJD2	Q9UKL4	321 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CFAP54-208	ENST00000556591	CBY3	A6NI87	242 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CFAP54-208	ENST00000556591	VWA5A	O00534	786 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CFAP54-208	ENST00000556591	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64

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