RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542557.5

PTPRO-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 2,946 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-208ENST00000542557 SLC10A3P09131 477 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 SLC2A3P11169 496 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 SERPINB5P36952 375 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 ABCG1P45844 678 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 PSEN1P49768 467 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 TUBP50607 506 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 NDST2P52849 883 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 SLC25A3Q00325 362 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 KLC1Q07866 573 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 TNK2Q07912 1038 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 USP4Q13107 963 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 CRHR2Q13324 411 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 TRIM68Q6AZZ1 485 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 RANBP10Q6VN20 620 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 GALNT7Q86SF2 657 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 ARHGAP18Q8N392 663 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 KLHDC9Q8NEP7 349 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 DTX3LQ8TDB6 740 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 HASPINQ8TF76 798 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 SLC39A13Q96H72 371 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 RANBP9Q96S59 729 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 CCDC28BQ9BUN5 200 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 ARNT2Q9HBZ2 717 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 TCF7L2Q9NQB0 619 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 NDE1Q9NXR1 346 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 CDH22Q9UJ99 828 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 SCML2Q9UQR0 700 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 TLR6Q9Y2C9 796 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 ACOT9Q9Y305 439 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 HS3ST4Q9Y661 456 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 WASF2Q9Y6W5 498 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 MSI1O43347 362 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 ZBTB14O43829 449 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 ITGB1P05556 798 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 ASGR1P07306 291 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 F7P08709 466 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 COX4I1P13073 169 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 STMN1P16949 149 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 ITGAXP20702 1163 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 GRIK1P39086 918 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 GRIA4P48058 902 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 CD151P48509 253 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 RPL14P50914 215 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 FCGRTP55899 365 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 KLF10Q13118 480 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 LBRQ14739 615 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 POU6F1Q14863 301 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 SEL1L3Q68CR1 1132 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 RGMBQ6NW40 437 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 KDELC1Q6UW63 502 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 MON1AQ86VX9 555 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 POU5F2Q8N7G0 328 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 MAPK15Q8TD08 544 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 MRGPRX2Q96LB1 330 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 C8orf48Q96LL4 319 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 GPR78Q96P69 363 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 FSD1LQ9BXM9 530 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 SLC25A51Q9H1U9 297 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 NMUR1Q9HB89 426 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 RRAGCQ9HB90 399 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 ATP13A1Q9HD20 1204 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 XPR1Q9UBH6 696 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 A0A1W2PQH9 124 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 HEATR9A2RTY3 570 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 GOLGA8TH3BQL2 631 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 DCXO43602 365 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 NPHS1O60500 1241 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 OAZ2O95190 189 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 VAPBO95292 243 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 PEX11BO96011 259 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 RHOQP17081 205 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 MPSTP25325 297 aa6.62□□□□□ -1.35
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