RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519057.5

COPS5-208, Transcript of COP9 signalosome subunit 5, human

TSL 4

Gene COPS5, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS5-208	ENST00000519057	YWHAQ	P27348	245 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	IL13RA2	Q14627	380 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	SETD9	Q8NE22	299 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	TXNDC15	Q96J42	360 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	DHDH	Q9UQ10	334 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	OR6C68	A6NDL8	312 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	FAM157A	C9JC47	383 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	TIMM23	O14925	209 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	STRN	O43815	780 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	PLIN1	O60240	522 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	SERPINI2	O75830	405 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	KRT38	O76015	456 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	CBX6	O95503	412 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	GPR12	P47775	334 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	ARHGAP8	P85298	464 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	FAM27E3	Q08E93	113 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	BLMH	Q13867	455 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF114	Q8NC26	417 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	POF1B	Q8WVV4	589 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	IGSF21	Q96ID5	467 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	DUX5	Q96PT3	197 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057		A0A096LPK6	155 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057		A0A0U1RQJ8	604 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057		A0A1B0GVM2	712 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	SEPT4	O43236	478 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	DAO	P14920	347 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	MCM2	P49736	904 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	4.58	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	SLC18A2	Q05940	514 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	SLC39A14	Q15043	492 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	ME3	Q16798	604 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	LINS1	Q8NG48	757 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	SCN5A	Q14524	2016 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057		J3KR12	359 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	CHL1	O00533	1208 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	LINC01565	O15544	149 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	FAM155B	O75949	473 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	KRT36	O76013	467 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	GAS8-AS1	O95177	125 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	UMOD	P07911	640 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	MYBPH	Q13203	477 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	TIGD6	Q17RP2	521 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	CCDC38	Q502W7	563 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	GJB7	Q6PEY0	223 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	GOLGA1	Q92805	767 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	ADGRG7	Q96K78	797 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	TMEM51	Q9NW97	253 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057		F5H423	210 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	BUB3	O43684	328 aa		4.56	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	CTPS1	P17812	591 aa		4.56	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	CUL4B	Q13620	913 aa		4.56	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	FBXO43	Q4G163	708 aa		4.56	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		4.56	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		4.56	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	THAP4	Q8WY91	577 aa		4.56	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	NCSTN	Q92542	709 aa		4.56	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	MASTL	Q96GX5	879 aa		4.56	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	CD207	Q9UJ71	328 aa		4.56	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	HBP1	O60381	514 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	ADA	P00813	363 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	CD72	P21854	359 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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