RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516539.1

RNU6-1256P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1256, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1256P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1256P-201ENST00000516539 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 LIG4P49917 911 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 STAT2P52630 851 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 EFNA5P52803 228 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ARSFP54793 590 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 MFAP4P55083 255 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 F2RL1P55085 397 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 HDAC4P56524 1084 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 UBXN2AP68543 259 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 RBP5P82980 135 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 SLC25A3Q00325 362 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 TFCP2Q12800 502 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 FZD5Q13467 585 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 PCLAFQ15004 111 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 FAM153CQ494X1 144 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ADALQ6DHV7 355 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ZNF585AQ6P3V2 769 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 IL27RAQ6UWB1 636 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 DHRS13Q6UX07 377 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 TRIM72Q6ZMU5 477 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 RHOUQ7L0Q8 258 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 RFX6Q8HWS3 928 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 RHPN2Q8IUC4 686 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 HACE1Q8IYU2 909 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 EXD3Q8N9H8 876 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 CHST13Q8NET6 341 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 IL17DQ8TAD2 202 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ACTRT2Q8TDY3 377 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 AFAP1L1Q8TED9 768 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 GDPD5Q8WTR4 605 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 FAR1Q8WVX9 515 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 KAT2BQ92831 832 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 HAS1Q92839 578 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 SLC22A18Q96BI1 424 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ARHGEF26Q96DR7 871 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 P2RY11Q96G91 374 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 COQ10AQ96MF6 247 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 WDFY2Q96P53 400 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 HEMGNQ9BXL5 484 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 XYLT2Q9H1B5 865 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 IKZF4Q9H2S9 585 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 PSD3Q9NYI0 1048 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 OGFRQ9NZT2 677 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 FBXL17Q9UF56 701 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 RASAL2Q9UJF2 1139 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ZNF112Q9UJU3 913 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ICKQ9UPZ9 632 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 CARD8Q9Y2G2 431 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 TESMINQ9Y4I5 508 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 UTYO14607 1347 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 MAST3O60307 1309 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 CBY3A6NI87 242 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 LINC00473A8K010 186 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 UBE2Q2LH0YL09 131 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 EBAG9O00559 213 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 PSMA7O14818 248 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 EXOC3O60645 756 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 TBX10O75333 385 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 TFP02787 698 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ACTN1P12814 892 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 TNFRSF1AP19438 455 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 MUTP22033 750 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 CHRNA5P30532 468 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 THPOP40225 353 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 PIK3CAP42336 1068 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 CAMPP49913 170 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 PSMC6P62333 389 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 TAP1Q03518 808 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ACSM2AQ08AH3 577 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 BFSP1Q12934 665 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 GALNT3Q14435 633 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 COG2Q14746 738 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 PPP2R5BQ15173 497 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 SHBQ15464 509 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ADIPOQQ15848 244 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 PLK5Q496M5 336 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 FBXO43Q4G163 708 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ERICH6BQ5W0A0 696 aa3.38□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.4 ms