RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464454.1

CLK1-208, Transcript of CDC like kinase 1, human

TSL 2

Gene CLK1, Length 484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLK1-208	ENST00000464454	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	RRM2B	Q7LG56	351 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	CPXM2	Q8N436	756 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	HIPK3	Q9H422	1215 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	TAS2R10	Q9NYW0	307 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	KCND2	Q9NZV8	630 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	MST1R	Q04912	1400 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	DDAH2	O95865	285 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	TOMM40	O96008	361 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	UBL4A	P11441	157 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	TNFRSF1B	P20333	461 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	CD72	P21854	359 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	CHM	P24386	653 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	PTPN9	P43378	593 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	POLD2	P49005	469 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	EFNB1	P98172	346 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	KRT32	Q14532	448 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	FBXO43	Q4G163	708 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	AWAT2	Q6E213	333 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	PARM1	Q6UWI2	310 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	PCGF5	Q86SE9	256 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	TMEM199	Q8N511	208 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	FAR1	Q8WVX9	515 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF333	Q96JL9	665 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	SLC32A1	Q9H598	525 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	NLK	Q9UBE8	527 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	PEMT	Q9UBM1	199 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	TMCC1	O94876	653 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	ADA	P00813	363 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	FGF2	P09038	288 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	MYZAP	P0CAP1	466 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	RASSF2	P50749	326 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	CLCNKB	P51801	687 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	RPE65	Q16518	533 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454		Q5PR19	223 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	C17orf99	Q6UX52	265 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	BICD2	Q8TD16	824 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	SAAL1	Q96ER3	474 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	USP44	Q9H0E7	712 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	MPP6	Q9NZW5	540 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	SARDH	Q9UL12	918 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	CD8B2	A6NJW9	211 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	YWHAQ	P27348	245 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	CDC25A	P30304	524 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	ABCD1	P33897	745 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLK1-208	ENST00000464454	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71

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