RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 VILLO15195 856 aa24.36■■□□□ 1.49
SMKR1-201ENST00000462322 POP4O95707 220 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
SMKR1-201ENST00000462322 NUDT1P36639 197 aa24.36■■□□□ 1.49
SMKR1-201ENST00000462322 ARL4AP40617 200 aa24.36■■□□□ 1.49
SMKR1-201ENST00000462322 SSR1P43307 286 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
SMKR1-201ENST00000462322 NEK3P51956 506 aa24.36■■□□□ 1.49
SMKR1-201ENST00000462322 RHOAP61586 193 aa24.36■■□□□ 1.49
SMKR1-201ENST00000462322 DPYSL2Q16555 572 aa24.36■■□□□ 1.49
SMKR1-201ENST00000462322 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
SMKR1-201ENST00000462322 FBXL19Q6PCT2 694 aa24.36■■□□□ 1.49
SMKR1-201ENST00000462322 SARM1Q6SZW1 724 aa24.36■■□□□ 1.49
SMKR1-201ENST00000462322 NETO2Q8NC67 525 aa24.36■■□□□ 1.49
SMKR1-201ENST00000462322 LRIG1Q96JA1 1093 aa24.36■■□□□ 1.49
SMKR1-201ENST00000462322 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa24.36■■□□□ 1.49
SMKR1-201ENST00000462322 SLC39A8Q9C0K1 460 aa24.36■■□□□ 1.49
SMKR1-201ENST00000462322 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP24.36■■□□□ 1.49
SMKR1-201ENST00000462322 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
SMKR1-201ENST00000462322 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
SMKR1-201ENST00000462322 WNT9AO14904 365 aa24.35■■□□□ 1.49
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SMKR1-201ENST00000462322 H2AFZP0C0S5 128 aa24.35■■□□□ 1.49
SMKR1-201ENST00000462322 RARAP10276 462 aa24.35■■□□□ 1.49
SMKR1-201ENST00000462322 CD38P28907 300 aa24.35■■□□□ 1.49
SMKR1-201ENST00000462322 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
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SMKR1-201ENST00000462322 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
SMKR1-201ENST00000462322 SLC45A4Q5BKX6 768 aa24.35■■□□□ 1.49
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SMKR1-201ENST00000462322 NEK5Q6P3R8 708 aa24.35■■□□□ 1.49
SMKR1-201ENST00000462322 H2AFVQ71UI9 128 aa24.35■■□□□ 1.49
SMKR1-201ENST00000462322 CNGA4Q8IV77 575 aa24.35■■□□□ 1.49
SMKR1-201ENST00000462322 CCDC42Q96M95 316 aa24.35■■□□□ 1.49
SMKR1-201ENST00000462322 CHP1Q99653 195 aa24.35■■□□□ 1.49
SMKR1-201ENST00000462322 PACSIN1Q9BY11 444 aa24.35■■□□□ 1.49
SMKR1-201ENST00000462322 TM7SF3Q9NS93 570 aa24.35■■□□□ 1.49
SMKR1-201ENST00000462322 UVRAGQ9P2Y5 699 aa24.35■■□□□ 1.49
SMKR1-201ENST00000462322 DMTF1Q9Y222 760 aa24.35■■□□□ 1.49
SMKR1-201ENST00000462322 PCNX2A6NKB5 2137 aa24.34■■□□□ 1.49
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SMKR1-201ENST00000462322 KCNK3O14649 394 aa24.34■■□□□ 1.49
SMKR1-201ENST00000462322 PRAMEF11O60813 436 aa24.34■■□□□ 1.49
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SMKR1-201ENST00000462322 ZNF883P0CG24 379 aa24.34■■□□□ 1.49
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SMKR1-201ENST00000462322 RAD51Q06609 339 aa24.34■■□□□ 1.49
SMKR1-201ENST00000462322 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa24.34■■□□□ 1.49
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SMKR1-201ENST00000462322 HORMAD1Q86X24 394 aa24.34■■□□□ 1.49
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SMKR1-201ENST00000462322 ZNF423Q2M1K9 1284 aa24.31■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF284Q2VY69 593 aa24.31■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 TMCO3Q6UWJ1 677 aa24.31■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 MFSD2AQ8NA29 543 aa24.31■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 FEM1CQ96JP0 617 aa24.31■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 CAMK1GQ96NX5 476 aa24.31■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa24.31■■□□□ 1.48
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