RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 AKR1A1P14550 325 aa20.73■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 PGFP49763 221 aa20.73■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 SLC5A3P53794 718 aa20.73■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 BRMS1LQ5PSV4 323 aa20.73■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 TMEM198Q66K66 360 aa20.73■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 ZNF470Q6ECI4 717 aa20.73■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 OVOS1Q6IE37 1185 aa20.73■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 POTEHQ6S545 545 aa20.73■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 LCA5Q86VQ0 697 aa20.73■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 EBF3Q9H4W6 596 aa20.73■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 ABCC13Q9NSE7 274 aa20.73■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 CDYLQ9Y232 598 aa20.73■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 ENO4A6NNW6 628 aa20.72■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 JUNP05412 331 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 LYNP07948 512 aa20.72■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 PEX2P28328 305 aa20.72■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 CHRNA4P43681 627 aa20.72■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 LZTR1Q8N653 840 aa20.72■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 PHC3Q8NDX5 983 aa20.72■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 GDPD5Q8WTR4 605 aa20.72■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 CASP10Q92851 521 aa20.72■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 PPP2R3CQ969Q6 453 aa20.72■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 SGF29Q96ES7 293 aa20.72■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 CNDP1Q96KN2 507 aa20.72■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 CATSPER2Q96P56 530 aa20.72■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 TRPV6Q9H1D0 765 aa20.72■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 VCX3BQ9H321 246 aa20.72■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 MPP6Q9NZW5 540 aa20.72■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 TARM1B6A8C7 271 aa20.72■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 CD52P31358 61 aa20.72■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 GRIK1P39086 918 aa20.72■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 HK2P52789 917 aa20.72■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 DLG1Q12959 904 aa20.72■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 PCSK7Q16549 785 aa20.72■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 PDSS2Q86YH6 399 aa20.72■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 LSMEM2Q8N112 164 aa20.72■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 SCML4Q8N228 414 aa20.72■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 MARK4Q96L34 752 aa20.72■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 PKMYT1Q99640 499 aa20.72■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa20.72■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 VTI1BQ9UEU0 232 aa20.72■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 MGEA5O60502 916 aa20.71■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 PAMP19021 973 aa20.71■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 TRIP10Q15642 601 aa20.71■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 KYQ8NBH2 561 aa20.71■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 KLHL4Q9C0H6 718 aa20.71■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 SLCO1B7G3V0H7 640 aa20.71■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 CYP11A1P05108 521 aa20.71■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 ADRA1AP35348 466 aa20.71■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 SLC12A2P55011 1212 aa20.71■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 TSPY1Q01534 308 aa20.71■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 SFT2D3Q587I9 215 aa20.71■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 C16orf89Q6UX73 402 aa20.71■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 DSELQ8IZU8 1212 aa20.71■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 GPR78Q96P69 363 aa20.71■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 DSEQ9UL01 958 aa20.71■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 PADI3Q9ULW8 664 aa20.71■□□□□ 0.91
IMP4-208ENST00000460766 TMEM233B4DJY2 109 aa20.7■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 F8W810 466 aa20.7■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 ITGB1P05556 798 aa20.7■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 HOXC13P31276 330 aa20.7■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 CD151P48509 253 aa20.7■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 TAS2R39P59534 338 aa20.7■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 GRIK3Q13003 919 aa20.7■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 MANEALQ5VSG8 457 aa20.7■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 KBTBD6Q86V97 674 aa20.7■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 THEM5Q8N1Q8 247 aa20.7■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 RSPH1Q8WYR4 309 aa20.7■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 RCN3Q96D15 328 aa20.7■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 MRGPRX2Q96LB1 330 aa20.7■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa20.7■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 TSC22D3Q99576 134 aa20.7■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 SMOC2Q9H3U7 446 aa20.7■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 ASB3Q9Y575 518 aa20.7■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 E9PAM4 449 aa20.7■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 THPOP40225 353 aa20.7■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 NOMO2Q5JPE7 1267 aa20.7■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 TSTD2Q5T7W7 516 aa20.7■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 CD300LGQ6UXG3 332 aa20.7■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 BEND5Q7L4P6 421 aa20.7■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 SERPINI1Q99574 410 aa20.7■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 FBXO5Q9UKT4 447 aa20.7■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms