RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436881.2

C9orf172-201, Transcript of Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene C9orf172, Length 4,387 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172-201ENST00000436881 INSCQ1MX18 579 aa16.24■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 DHFR2Q86XF0 187 aa16.24■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 FAM126BQ8IXS8 530 aa16.24■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 HGH1Q9BTY7 390 aa16.24■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa16.24■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 PLLPQ9Y342 182 aa16.24■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 DPPA5A6NC42 116 aa16.24■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 C2P06681 752 aa16.24■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 ASGR1P07306 291 aa16.24■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 L1CAMP32004 1257 aa16.24■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 HTR7P34969 479 aa16.24■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 TBCELQ5QJ74 424 aa16.24■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 PLEKHO2Q8TD55 490 aa16.24■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 ZNF570Q96NI8 536 aa16.24■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa16.24■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 KATNA1O75449 491 aa16.23■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 ARIH2O95376 493 aa16.23■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 LBPP18428 481 aa16.23■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 TTPAP49638 278 aa16.23■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 WDR4P57081 412 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 TAF5Q15542 800 aa16.23■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 ANKRD22Q5VYY1 191 aa16.23■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 ERAP2Q6P179 960 aa16.23■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 CMC1Q7Z7K0 106 aa16.23■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 BTN2A3PQ96KV6 586 aa16.23■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 XPR1Q9UBH6 696 aa16.23■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 GCATO75600 419 aa16.23■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 PSMD5Q16401 504 aa16.23■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 FNBP1LQ5T0N5 605 aa16.23■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 CERCAMQ5T4B2 595 aa16.23■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 LIPMQ5VYY2 423 aa16.23■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa16.23■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 VPS33AQ96AX1 596 aa16.23■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 XYLBO75191 536 aa16.23■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 SERPINA6P08185 405 aa16.23■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 NAA20P61599 178 aa16.23■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 PPM1LQ5SGD2 360 aa16.23■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 CCDC149Q6ZUS6 474 aa16.23■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 LRRC8DQ7L1W4 858 aa16.23■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 CLNKQ7Z7G1 428 aa16.23■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 DENND1CQ8IV53 801 aa16.23■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 TNS4Q8IZW8 715 aa16.23■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 ZNF180Q9UJW8 692 aa16.23■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 F8W810 466 aa16.22■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 CLCNKBP51801 687 aa16.22■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 HK2P52789 917 aa16.22■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 CCL23P55773 120 aa16.22■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 PTPRNQ16849 979 aa16.22■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 FAM187BQ17R55 369 aa16.22■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 PCDH19Q8TAB3 1148 aa16.22■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 SLC35B2Q8TB61 432 aa16.22■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 HDAC10Q969S8 669 aa16.22■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 DPEP3Q9H4B8 488 aa16.22■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 ARL8BQ9NVJ2 186 aa16.22■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa16.22■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 CES1P23141 567 aa16.22■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 WARSP23381 471 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 DGKAP23743 735 aa16.22■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 CRHR1P34998 444 aa16.22■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 AFTPHQ6ULP2 937 aa16.22■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 TEPSINQ96N21 525 aa16.22■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 MECRQ9BV79 373 aa16.22■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 OPTCQ9UBM4 332 aa16.22■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 USP45Q70EL2 814 aa16.22■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 TMEM192Q8IY95 271 aa16.22■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 PCED1BQ96HM7 432 aa16.22■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 TTPALQ9BTX7 342 aa16.22■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 TEKT2Q9UIF3 430 aa16.22■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 AHCYL1O43865 530 aa16.22■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 AP2A1O95782 977 aa16.22■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 DAOAP59103 153 aa16.22■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 TAF10Q12962 218 aa16.22■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 NDNQ99608 321 aa16.22■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 WDR41Q9HAD4 459 aa16.22■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 CLCA2Q9UQC9 943 aa16.22■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 VWA7Q9Y334 891 aa16.22■□□□□ 0.19
C9orf172-201ENST00000436881 STYXL1Q9Y6J8 313 aa16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms