RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436228.6

SPDYE2B-201, Transcript of speedy/RINGO cell cycle regulator family member E2B, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPDYE2B, Length 1,209 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYE2B-201ENST00000436228 POP4O95707 220 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 ZNF806P0C7X5 589 aa16.93■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 C5AR1P21730 350 aa16.93■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 CCNCP24863 283 aa16.93■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 PTPN7P35236 360 aa16.93■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 P2RY2P41231 377 aa16.93■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 SEL1L2Q5TEA6 688 aa16.93■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 MARC1Q5VT66 337 aa16.93■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 PMS2CLQ68D20 193 aa16.93■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa16.93■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 LPCAT2Q7L5N7 544 aa16.93■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa16.93■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa16.93■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 NETO1Q8TDF5 533 aa16.93■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 RLN3Q8WXF3 142 aa16.93■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 ALG3Q92685 438 aa16.93■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 PPP1R16AQ96I34 528 aa16.93■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 BRD8Q9H0E9 1235 aa16.93■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa16.93■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 ITM2CQ9NQX7 267 aa16.93■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 DTLQ9NZJ0 730 aa16.93■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 SHROOM3Q8TF72 1996 aa16.93■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 KRIT1O00522 736 aa16.92■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 MID1O15344 667 aa16.92■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 PYGMP11217 842 aa16.92■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 TGM1P22735 817 aa16.92■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 MPLP40238 635 aa16.92■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 TPMTP51580 245 aa16.92■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 CREB5Q02930 508 aa16.92■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 GRM3Q14832 879 aa16.92■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 CYTH1Q15438 398 aa16.92■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 MYLK3Q32MK0 819 aa16.92■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 MEI1Q5TIA1 1274 aa16.92■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 BBS12Q6ZW61 710 aa16.92■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 USP30Q70CQ3 517 aa16.92■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 REXO1L1PQ8IX06 675 aa16.92■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 CCDC13Q8IYE1 715 aa16.92■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 PAF1Q8N7H5 531 aa16.92■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 CHST14Q8NCH0 376 aa16.92■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 TMIEQ8NEW7 156 aa16.92■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 HDAC11Q96DB2 347 aa16.92■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 LRIG1Q96JA1 1093 aa16.92■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 TSGA13Q96PP4 275 aa16.92■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 PARD6AQ9NPB6 346 aa16.92■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 FBXL12Q9NXK8 326 aa16.92■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 THADAQ6YHU6 1953 aa16.91■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 MATN3O15232 486 aa16.91■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 CD6P30203 668 aa16.91■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 MMP13P45452 471 aa16.91■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 MAPK8P45983 427 aa16.91■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 AP1B1Q10567 949 aa16.91■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 MAP7D1Q3KQU3 841 aa16.91■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 ARSIQ5FYB1 569 aa16.91■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 NPNTQ6UXI9 565 aa16.91■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 FAM124AQ86V42 546 aa16.91■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 HDDC3Q8N4P3 179 aa16.91■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 OR6K2Q8NGY2 324 aa16.91■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 RMDN1Q96DB5 314 aa16.91■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 FERMT1Q9BQL6 677 aa16.91■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 RTKNQ9BST9 563 aa16.91■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa16.91■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 DLL3Q9NYJ7 618 aa16.91■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 LHX3Q9UBR4 397 aa16.91■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 PPM1HQ9ULR3 514 aa16.91■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa16.91■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 VPS13AQ96RL7 3174 aa16.91■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa16.9■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 A0A1W2PP55 124 aa16.9■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa16.9■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 LEFTY1O75610 366 aa16.9■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 APOC2P02655 101 aa16.9■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 ZNF33AQ06730 810 aa16.9■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 SLC10A7Q0GE19 358 aa16.9■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 ZNF569Q5MCW4 686 aa16.9■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 CFAP58Q5T655 872 aa16.9■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 CYP2U1Q7Z449 544 aa16.9■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 SRLQ86TD4 932 aa16.9■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 FATE1Q969F0 183 aa16.9■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 HAUS1Q96CS2 278 aa16.9■□□□□ 0.3
SPDYE2B-201ENST00000436228 EXOC2Q96KP1 924 aa16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.8 ms