RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428585.5

CARF-208, Transcript of calcium responsive transcription factor, human

TSL 2 BASIC

Gene CARF, Length 2,513 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CARF-208	ENST00000428585	MYO1E	Q12965	1108 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	LRRC24	Q50LG9	513 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	ADAL	Q6DHV7	355 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	ANO7	Q6IWH7	933 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	4.74	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	CCDC80	Q76M96	950 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	MON1A	Q86VX9	555 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	POGLUT1	Q8NBL1	392 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	CFHR4	Q92496	578 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	SLC35B4	Q969S0	331 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	CFAP36	Q96G28	342 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	VPS50	Q96JG6	964 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	PLVAP	Q9BX97	442 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	TEX12	Q9BXU0	123 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	WDCP	Q9H6R7	721 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	DNAJC18	Q9H819	358 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	DAPP1	Q9UN19	280 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	IKBKB	O14920	756 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	LAMTOR5	O43504	91 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	LRIG2	O94898	1065 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	APOL3	O95236	402 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	ASMT	P46597	345 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	CAPZA2	P47755	286 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	ATP8B2	P98198	1209 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	PPARA	Q07869	468 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	SLC13A2	Q13183	592 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	CUL3	Q13618	768 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	SMYD1	Q8NB12	490 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	NCSTN	Q92542	709 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	RSC1A1	Q92681	617 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	PDLIM5	Q96HC4	596 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	CHST8	Q9H2A9	424 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	RAD18	Q9NS91	495 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585		E7EVH7	732 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585		J3QL48	77 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	ZSCAN12	O43309	604 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	DNPH1	O43598	174 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	GDF11	O95390	407 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	BAG3	O95817	575 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	FTCD	O95954	541 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	LRG1	P02750	347 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	CELA3B	P08861	270 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	LINGO3	P0C6S8	592 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	LINC00271	P0C7V0	271 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	PDHB	P11177	359 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	ETV3	P41162	512 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	BCL6	P41182	706 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	NT5C2	P49902	561 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	INHBC	P55103	352 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	TDG	Q13569	410 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	CAMK1	Q14012	370 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	MPP7	Q5T2T1	576 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	TTC22	Q5TAA0	569 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	KRT80	Q6KB66	452 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CARF-208	ENST00000428585	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		4.73	□□□□□ -1.65

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