RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427641.2

NCBP2-204, Transcript of nuclear cap binding protein subunit 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NCBP2, Length 1,946 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP2-204ENST00000427641 GRM2Q14416 872 aa14.64□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa14.64□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 SLC8B1Q6J4K2 584 aa14.64□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa14.64□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 TAS1R1Q7RTX1 841 aa14.64□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 DHDDSQ86SQ9 333 aa14.64□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 ACTRT2Q8TDY3 377 aa14.64□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 TOP1MTQ969P6 601 aa14.64□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 RILPQ96NA2 401 aa14.64□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 SORT1Q99523 831 aa14.64□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 VAT1Q99536 393 aa14.64□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa14.64□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 GLRA3O75311 464 aa14.63□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 USP1O94782 785 aa14.63□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 TIMP1P01033 207 aa14.63□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 SERPINE1P05121 402 aa14.63□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 LAG3P18627 525 aa14.63□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 GARSP41250 739 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 GRIA1P42261 906 aa14.63□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 SLC1A6P48664 564 aa14.63□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 IDH3AP50213 366 aa14.63□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 ZNF33AQ06730 810 aa14.63□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 EFEMP1Q12805 493 aa14.63□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 TAF10Q12962 218 aa14.63□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 MTA1Q13330 715 aa14.63□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 INSCQ1MX18 579 aa14.63□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 TMEM199Q8N511 208 aa14.63□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 GPR152Q8TDT2 470 aa14.63□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 GBP5Q96PP8 586 aa14.63□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 TTC1Q99614 292 aa14.63□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 FAM96AQ9H5X1 160 aa14.63□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 OSER1Q9NX31 292 aa14.63□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 IGSF9Q9P2J2 1179 aa14.63□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 NUDT5Q9UKK9 219 aa14.63□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 TRHDEQ9UKU6 1024 aa14.63□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa14.63□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 SLC38A8A6NNN8 435 aa14.62□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 KCNU1A8MYU2 1149 aa14.62□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 SIN3BO75182 1162 aa14.62□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 SOAT2O75908 522 aa14.62□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 PROCP04070 461 aa14.62□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 SOD2P04179 222 aa14.62□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 RAG1P15918 1043 aa14.62□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 GRK2P25098 689 aa14.62□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 PRDX6P30041 224 aa14.62□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 HOXC13P31276 330 aa14.62□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 ARRB2P32121 409 aa14.62□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 PGFP49763 221 aa14.62□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 SLC25A3Q00325 362 aa14.62□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 PCLAFQ15004 111 aa14.62□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 LRRC26Q2I0M4 334 aa14.62□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 C10orf120Q5SQS8 335 aa14.62□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 C16orf46Q6P387 395 aa14.62□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 PACS1Q6VY07 963 aa14.62□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 RAPH1Q70E73 1250 aa14.62□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 PID1Q7Z2X4 250 aa14.62□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 NECAB2Q7Z6G3 386 aa14.62□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 NPWQ8N729 165 aa14.62□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa14.62□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 JADE3Q92613 823 aa14.62□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 ISL2Q96A47 359 aa14.62□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 C1orf74Q96LT6 269 aa14.62□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa14.62□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 DCDC2Q9UHG0 476 aa14.62□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 WDR27A2RRH5 827 aa14.62□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 OR1D2P34982 312 aa14.62□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 MAGEA12P43365 314 aa14.62□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 NUMBP49757 651 aa14.62□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 ZNF567Q8N184 647 aa14.62□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 ATPAF2Q8N5M1 289 aa14.62□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 NETO2Q8NC67 525 aa14.62□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 PDZD8Q8NEN9 1154 aa14.62□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 ARNTL2Q8WYA1 636 aa14.62□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 SLC39A13Q96H72 371 aa14.62□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 SPATA16Q9BXB7 569 aa14.62□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 EBF3Q9H4W6 596 aa14.62□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 MARCH2Q9P0N8 246 aa14.62□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 FNIP2Q9P278 1114 aa14.62□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
NCBP2-204ENST00000427641 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms