RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409766.7

USP39-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 39, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP39, Length 2,033 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39-204ENST00000409766 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 IL10RBQ08334 325 aa20.37■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 KRT72Q14CN4 511 aa20.37■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP20.37■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 ATG14Q6ZNE5 492 aa20.37■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 DEFB128Q7Z7B8 93 aa20.37■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 DENND6AQ8IWF6 608 aa20.37■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa20.37■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa20.37■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 PRKD2Q9BZL6 878 aa20.37■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 NMUR2Q9GZQ4 415 aa20.37■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 NOD2Q9HC29 1040 aa20.37■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa20.37■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 PARNO95453 639 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 RALBP11234 206 aa20.37■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 PTPN4P29074 926 aa20.37■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 OR1D2P34982 312 aa20.37■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 DSC2Q02487 901 aa20.37■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 ITKQ08881 620 aa20.37■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 CTBP1Q13363 440 aa20.37■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 ZNF354CQ86Y25 554 aa20.37■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 PGBD5Q8N414 524 aa20.37■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 SLC25A41Q8N5S1 370 aa20.37■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 NSMCE1Q8WV22 266 aa20.37■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 TADA1Q96BN2 335 aa20.37■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 SORT1Q99523 831 aa20.37■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 SIKE1Q9BRV8 207 aa20.37■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 CWH43Q9H720 699 aa20.37■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 DNMT3LQ9UJW3 386 aa20.37■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 BACE2Q9Y5Z0 518 aa20.37■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 CHD5Q8TDI0 1954 aa20.37■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 G3V2L1 256 aa20.36■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 UPP2O95045 317 aa20.36■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 PAMP19021 973 aa20.36■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 ARRB2P32121 409 aa20.36■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 TUFMP49411 452 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 MPP1Q00013 466 aa20.36■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 C5orf22Q49AR2 442 aa20.36■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 SNX30Q5VWJ9 437 aa20.36■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 ARRDC2Q8TBH0 407 aa20.36■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 MAGEC3Q8TD91 643 aa20.36■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 NSL1Q96IY1 281 aa20.36■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa20.36■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 NMRAL1Q9HBL8 299 aa20.36■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa20.36■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa20.36■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 A8MUI8 341 aa20.36■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 ACVRL1P37023 503 aa20.36■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 ITGA9Q13797 1035 aa20.36■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 SEPT6Q14141 434 aa20.36■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 USP10Q14694 798 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 RANBP9Q96S59 729 aa20.36■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 TLE6Q9H808 572 aa20.36■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 HEATR9A2RTY3 570 aa20.35■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 F5H5T6 163 aa20.35■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 CHUKO15111 745 aa20.35■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 SLC1A2P43004 574 aa20.35■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 POLD2P49005 469 aa20.35■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 HARS2P49590 506 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 RAPH1Q70E73 1250 aa20.35■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 LGI2Q8N0V4 545 aa20.35■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 IGSF21Q96ID5 467 aa20.35■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 CD248Q9HCU0 757 aa20.35■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 TLK1Q9UKI8 766 aa20.35■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 ACSL4O60488 711 aa20.34■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 PRAMEF11O60813 436 aa20.34■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 SLC35E2BP0CK96 405 aa20.34■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 SLC6A4P31645 630 aa20.34■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 MNAT1P51948 309 aa20.34■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 LBRQ14739 615 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa20.34■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 MFSD6LQ8IWD5 586 aa20.34■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 PDZD8Q8NEN9 1154 aa20.34■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 OVCA2Q8WZ82 227 aa20.34■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 EBF4Q9BQW3 602 aa20.34■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 RNF208Q9H0X6 261 aa20.34■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 ARMCX1Q9P291 453 aa20.34■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 ZNF840PA6NDX5 716 aa20.34■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 CAPN14A8MX76 684 aa20.34■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 CCDC22O60826 627 aa20.34■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 SAT1P21673 171 aa20.34■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 CALB2P22676 271 aa20.34■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 ZNF470Q6ECI4 717 aa20.34■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 RFWD3Q6PCD5 774 aa20.34■□□□□ 0.85
USP39-204ENST00000409766 LCA5Q86VQ0 697 aa20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms