RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401498.6

PKDCC-202, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 5

Gene PKDCC, Length 1,550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-202ENST00000401498 JRKLQ9Y4A0 524 aa30.54■■■□□ 2.48
PKDCC-202ENST00000401498 ABCA7Q8IZY2 2146 aa30.53■■■□□ 2.48
PKDCC-202ENST00000401498 KRIT1O00522 736 aa30.53■■■□□ 2.48
PKDCC-202ENST00000401498 KCNK3O14649 394 aa30.53■■■□□ 2.48
PKDCC-202ENST00000401498 ENC1O14682 589 aa30.53■■■□□ 2.48
PKDCC-202ENST00000401498 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP30.53■■■□□ 2.48
PKDCC-202ENST00000401498 KIF5CO60282 957 aa30.53■■■□□ 2.48
PKDCC-202ENST00000401498 MMP13P45452 471 aa30.53■■■□□ 2.48
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF33AQ06730 810 aa30.53■■■□□ 2.48
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PKDCC-202ENST00000401498 ZNF235Q14590 738 aa30.53■■■□□ 2.48
PKDCC-202ENST00000401498 POM121L1PQ3SYA9 428 aa30.53■■■□□ 2.48
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PKDCC-202ENST00000401498 FAM46CQ5VWP2 391 aa30.53■■■□□ 2.48
PKDCC-202ENST00000401498 BRD8Q9H0E9 1235 aa30.53■■■□□ 2.48
PKDCC-202ENST00000401498 CARD9Q9H257 536 aa30.53■■■□□ 2.48
PKDCC-202ENST00000401498 NUMA1Q14980 2115 aa30.52■■■□□ 2.48
PKDCC-202ENST00000401498 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa30.52■■■□□ 2.48
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PKDCC-202ENST00000401498 CCNB1P14635 433 aa30.52■■■□□ 2.48
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PKDCC-202ENST00000401498 AP1B1Q10567 949 aa30.52■■■□□ 2.48
PKDCC-202ENST00000401498 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
PKDCC-202ENST00000401498 CCDC181Q5TID7 509 aa30.52■■■□□ 2.48
PKDCC-202ENST00000401498 SPACA7Q96KW9 195 aa30.52■■■□□ 2.48
PKDCC-202ENST00000401498 FBXL12Q9NXK8 326 aa30.52■■■□□ 2.48
PKDCC-202ENST00000401498 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
PKDCC-202ENST00000401498 A0A1W2PP55 124 aa30.51■■■□□ 2.47
PKDCC-202ENST00000401498 KCNK1O00180 336 aa30.51■■■□□ 2.47
PKDCC-202ENST00000401498 GJB3O75712 270 aa30.51■■■□□ 2.47
PKDCC-202ENST00000401498 DRD3P35462 400 aa30.51■■■□□ 2.47
PKDCC-202ENST00000401498 CSNK1DP48730 415 aa30.51■■■□□ 2.47
PKDCC-202ENST00000401498 NOMO1Q15155 1222 aa30.51■■■□□ 2.47
PKDCC-202ENST00000401498 USP30Q70CQ3 517 aa30.51■■■□□ 2.47
PKDCC-202ENST00000401498 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP30.51■■■□□ 2.47
PKDCC-202ENST00000401498 ACTL9Q8TC94 416 aa30.51■■■□□ 2.47
PKDCC-202ENST00000401498 KCND1Q9NSA2 647 aa30.51■■■□□ 2.47
PKDCC-202ENST00000401498 SPAG17Q6Q759 2223 aa30.51■■■□□ 2.47
PKDCC-202ENST00000401498 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa30.5■■■□□ 2.47
PKDCC-202ENST00000401498 PLK4O00444 970 aa30.5■■■□□ 2.47
PKDCC-202ENST00000401498 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP30.5■■■□□ 2.47
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PKDCC-202ENST00000401498 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
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PKDCC-202ENST00000401498 SRLQ86TD4 932 aa30.5■■■□□ 2.47
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PKDCC-202ENST00000401498 BBS5Q8N3I7 341 aa30.5■■■□□ 2.47
PKDCC-202ENST00000401498 HDDC3Q8N4P3 179 aa30.5■■■□□ 2.47
PKDCC-202ENST00000401498 ARRDC3Q96B67 414 aa30.5■■■□□ 2.47
PKDCC-202ENST00000401498 LRIG1Q96JA1 1093 aa30.5■■■□□ 2.47
PKDCC-202ENST00000401498 MGME1Q9BQP7 344 aa30.5■■■□□ 2.47
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PKDCC-202ENST00000401498 OMDQ99983 421 aa30.49■■■□□ 2.47
PKDCC-202ENST00000401498 NEUROG2Q9H2A3 272 aa30.49■■■□□ 2.47
PKDCC-202ENST00000401498 NT5MQ9NPB1 228 aa30.49■■■□□ 2.47
PKDCC-202ENST00000401498 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP30.49■■■□□ 2.47
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PKDCC-202ENST00000401498 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP30.49■■■□□ 2.47
PKDCC-202ENST00000401498 CR2P20023 1033 aa30.49■■■□□ 2.47
PKDCC-202ENST00000401498 CD6P30203 668 aa30.49■■■□□ 2.47
PKDCC-202ENST00000401498 OXTRP30559 389 aa30.49■■■□□ 2.47
PKDCC-202ENST00000401498 SCNN1BP51168 640 aa30.49■■■□□ 2.47
PKDCC-202ENST00000401498 MAXP61244 160 aa30.49■■■□□ 2.47
PKDCC-202ENST00000401498 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP30.49■■■□□ 2.47
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PKDCC-202ENST00000401498 ZBTB17Q13105 803 aa30.49■■■□□ 2.47
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PKDCC-202ENST00000401498 KBTBD6Q86V97 674 aa30.49■■■□□ 2.47
PKDCC-202ENST00000401498 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP30.49■■■□□ 2.47
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PKDCC-202ENST00000401498 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa30.49■■■□□ 2.47
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PKDCC-202ENST00000401498 JCHAINP01591 159 aa30.48■■■□□ 2.47
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PKDCC-202ENST00000401498 CNTN1Q12860 1018 aa30.48■■■□□ 2.47
PKDCC-202ENST00000401498 XRCC4Q13426 336 aa30.48■■■□□ 2.47
PKDCC-202ENST00000401498 FAM131CQ96AQ9 280 aa30.48■■■□□ 2.47
PKDCC-202ENST00000401498 CXCR5P32302 372 aa30.47■■■□□ 2.47
PKDCC-202ENST00000401498 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
PKDCC-202ENST00000401498 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP30.47■■■□□ 2.47
PKDCC-202ENST00000401498 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP30.47■■■□□ 2.47
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