RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 SLC12A8A0AV02 714 aa6.14□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 TLDC2A0PJX2 215 aa6.14□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 FAM159BA6NKW6 160 aa6.14□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 KCNK1O00180 336 aa6.14□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 GFRA2O00451 464 aa6.14□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 MATN3O15232 486 aa6.14□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 PSMD3O43242 534 aa6.14□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 COCHO43405 550 aa6.14□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 AVILO75366 819 aa6.14□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 LATS1O95835 1130 aa6.14□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 C1RP00736 705 aa6.14□□□□□ -1.43
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C6orf48-208ENST00000395788 SRGAP2BP0DMP2 458 aa6.14□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 ACRP10323 421 aa6.14□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 PSMB4P28070 264 aa6.14□□□□□ -1.43
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C6orf48-208ENST00000395788 SLCO1A2P46721 670 aa6.14□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 MAPKAPK2P49137 400 aa6.14□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 LMAN1P49257 510 aa6.14□□□□□ -1.43
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C6orf48-208ENST00000395788 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 SARNPP82979 210 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM240Q5SV17 173 aa6.14□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 HECTD3Q5T447 861 aa6.14□□□□□ -1.43
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C6orf48-208ENST00000395788 NADSYN1Q6IA69 706 aa6.14□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 KIAA1841Q6NSI8 718 aa6.14□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 FBXL22Q6P050 247 aa6.14□□□□□ -1.43
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C6orf48-208ENST00000395788 SH2D5Q6ZV89 423 aa6.14□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 RTL10Q7L3V2 364 aa6.14□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 TAOK1Q7L7X3 1001 aa6.14□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 PID1Q7Z2X4 250 aa6.14□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM150AQ86TG1 271 aa6.14□□□□□ -1.43
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C6orf48-208ENST00000395788 ANKMY2Q8IV38 441 aa6.14□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 PALM2Q8IXS6 379 aa6.14□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 CNPY4Q8N129 248 aa6.14□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 CCDC33Q8N5R6 958 aa6.14□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 TEX26Q8N6G2 289 aa6.14□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 NETO2Q8NC67 525 aa6.14□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 CCNYQ8ND76 341 aa6.14□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa6.14□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 FBF1Q8TES7 1133 aa6.14□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 GIPC2Q8TF65 315 aa6.14□□□□□ -1.43
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C6orf48-208ENST00000395788 HERVK_113Q902F9 699 aa6.14□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 IGSF8Q969P0 613 aa6.14□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 PSMG2Q969U7 264 aa6.14□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 COL26A1Q96A83 441 aa6.14□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 TADA1Q96BN2 335 aa6.14□□□□□ -1.43
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C6orf48-208ENST00000395788 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa6.14□□□□□ -1.43
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C6orf48-208ENST00000395788 UCN2Q96RP3 112 aa6.14□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 CYTH2Q99418 400 aa6.14□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 NAT9Q9BTE0 207 aa6.14□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
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C6orf48-208ENST00000395788 SIK2Q9H0K1 926 aa6.14□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 CENPHQ9H3R5 247 aa6.14□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 CCSER2Q9H7U1 834 aa6.14□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 VPS37BQ9H9H4 285 aa6.14□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
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C6orf48-208ENST00000395788 SENP1Q9P0U3 644 aa6.14□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa6.14□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF180Q9UJW8 692 aa6.14□□□□□ -1.43
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C6orf48-208ENST00000395788 ASB3Q9Y575 518 aa6.14□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa6.14□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 MYO16Q9Y6X6 1858 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 PTPRSQ13332 1948 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 SDR42E2A6NKP2 422 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 SMIM23A6NLE4 172 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 H3BNC9 293 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 J3QW42 95 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 TEX28O15482 410 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 ACSL4O60488 711 aa6.13□□□□□ -1.43
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