RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 NTRK2Q16620 822 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 FSCBQ5H9T9 825 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 CD276Q5ZPR3 534 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 SARM1Q6SZW1 724 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 MIER3Q7Z3K6 550 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 RSPH3Q86UC2 560 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 CABP7Q86V35 215 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 NPAS3Q8IXF0 933 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 BEND2Q8NDZ0 799 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 STMN2Q93045 179 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 LENG9Q96B70 501 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM186Q96B77 213 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 GIMAP5Q96F15 307 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 WDFY2Q96P53 400 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 OR10A5Q9H207 317 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 ANO10Q9NW15 660 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 MYOTQ9UBF9 498 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 HSPB7Q9UBY9 170 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 NFU1Q9UMS0 254 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 PCSK5Q92824 1860 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 M0R082 166 aa2.59□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TSC22D2O75157 780 aa2.59□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SURF6O75683 361 aaKnown RBP2.59□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 KAT7O95251 611 aa2.59□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 LARGE1O95461 756 aa2.59□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PDHA1P08559 390 aa2.59□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ARSAP15289 507 aa2.59□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CD6P30203 668 aa2.59□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PNPLA4P41247 253 aa2.59□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF81P51508 661 aa2.59□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 UCP3P55916 312 aa2.59□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PHEXP78562 749 aa2.59□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP2.59□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP2.59□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 BTBD16Q32M84 506 aa2.59□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 EPC2Q52LR7 807 aa2.59□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC122Q5T0U0 273 aa2.59□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SFRP5Q5T4F7 317 aa2.59□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TRIM68Q6AZZ1 485 aa2.59□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa2.59□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 KIF6Q6ZMV9 814 aa2.59□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 METTL23Q86XA0 190 aa2.59□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa2.59□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 IQCF2Q8IXL9 164 aa2.59□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 FAM9CQ8IZT9 166 aa2.59□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 MINDY1Q8N5J2 469 aa2.59□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TOP6BLQ8N6T0 577 aa2.59□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF366Q8N895 744 aa2.59□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa2.59□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 POC5Q8NA72 575 aa2.59□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 OR6C4Q8NGE1 309 aa2.59□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF417Q8TAU3 575 aa2.59□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP2.59□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 DGAT2Q96PD7 388 aa2.59□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 OR2A14Q96R47 310 aa2.59□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TXN2Q99757 166 aa2.59□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP2.59□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TEX12Q9BXU0 123 aa2.59□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 EPC1Q9H2F5 836 aa2.59□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PDZD7Q9H5P4 517 aa2.59□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 GLRX2Q9NS18 164 aa2.59□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 AIPL1Q9NZN9 384 aa2.59□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa2.59□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 DNAI1Q9UI46 699 aa2.59□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa2.59□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 KCNE2Q9Y6J6 123 aa2.59□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 A0A1W2PPM1 405 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 A0A1W2PQY0 241 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 A8MVJ9 347 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CCNDBP1O95273 360 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RB1P06400 928 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CYP3A4P08684 503 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RARGP13631 454 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RXRAP19793 462 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TKTP29401 623 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SERPINA4P29622 427 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PBX3P40426 434 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RABIFP47224 123 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 MTNR1AP48039 350 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 NDUFV1P49821 464 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 IL13RA1P78552 427 aa2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.5 ms