RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 TPI1P60174 286 aa7.8□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 IL9RQ01113 521 aa7.8□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC15Q0P6D6 951 aa7.8□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 SLC45A4Q5BKX6 768 aa7.8□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 CARD16Q5EG05 197 aa7.8□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 ARSIQ5FYB1 569 aa7.8□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 LEKR1Q6ZMV7 388 aa7.8□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF354CQ86Y25 554 aa7.8□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 DNAAF5Q86Y56 855 aa7.8□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 DNAJC7Q99615 494 aa7.8□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 NCAPGQ9BPX3 1015 aa7.8□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 HEPHQ9BQS7 1158 aa7.8□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 HDAC8Q9BY41 377 aa7.8□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 TM6SF2Q9BZW4 377 aa7.8□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 TRIM7Q9C029 511 aa7.8□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 FAM117AQ9C073 453 aa7.8□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 DEF6Q9H4E7 631 aa7.8□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa7.8□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa7.8□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 GDF3Q9NR23 364 aa7.8□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa7.8□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa7.8□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 LCMT1Q9UIC8 334 aa7.8□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 METRNQ9UJH8 293 aa7.8□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 AP4E1Q9UPM8 1137 aa7.8□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 DMTF1Q9Y222 760 aa7.8□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 SCINQ9Y6U3 715 aa7.8□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1B0GTQ1 180 aa7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1W2PQU0 124 aa7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1W2PR77 199 aa7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 WASH4PA8MWX3 477 aa7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 RASA4BC9J798 803 aa7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 TLR4O00206 839 aa7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 KCNK3O14649 394 aa7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 GPR37O15354 613 aa7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 RASA4O43374 803 aa7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 BUB1O43683 1085 aa7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 KDELR3O43731 214 aa7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 PRPSAP2O60256 369 aa7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 PCDHGA12O60330 932 aa7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 DFNA5O60443 496 aa7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 CBFA2T3O75081 653 aa7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 RNF8O76064 485 aa7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 TMCC1O94876 653 aa7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 PCDH8O95206 1070 aa7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 TRIM16O95361 564 aa7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 GSRP00390 522 aa7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 FTH1P19P0C7X4 201 aa7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 ADRB3P13945 408 aa7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 PRLRP16471 622 aa7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 CASP14P31944 242 aa7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 GRK6P43250 576 aa7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF75DP51815 510 aa7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 NEK3P51956 506 aa7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 NXPH1P58417 271 aa7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 SERINC3Q13530 473 aa7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 INAVAQ3KP66 663 aa7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 PARP15Q460N3 678 aa7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 HGSNATQ68CP4 663 aa7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 NEK5Q6P3R8 708 aa7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 GLRX5Q86SX6 157 aa7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 HORMAD1Q86X24 394 aa7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 OR2AP1Q8NGE2 309 aa7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 OR6K2Q8NGY2 324 aa7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 RHBDD1Q8TEB9 315 aa7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 FNIP1Q8TF40 1166 aa7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 HMCESQ96FZ2 354 aa7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 PEBP4Q96S96 227 aa7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 CDC6Q99741 560 aa7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 MYOCQ99972 504 aa7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 SCNM1Q9BWG6 230 aa7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 ISCUQ9H1K1 167 aa7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
SGMS1-201ENST00000361543 MYO1AQ9UBC5 1043 aa7.79□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.7 ms