RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 NUDCD1Q96RS6 583 aa28.17■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 GBA3Q9H227 469 aa28.17■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 RSPH14Q9UHP6 348 aa28.17■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 ATG13O75143 517 aa28.16■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 KRT14P02533 472 aa28.16■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 RGRP47804 291 aa28.16■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 SCNN1BP51168 640 aa28.16■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 RAD51Q06609 339 aa28.16■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 OR2A12Q8NGT7 310 aa28.16■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 CCHCR1Q8TD31 782 aa28.16■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 CLDN23Q96B33 292 aa28.16■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 SLC25A51Q9H1U9 297 aa28.16■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 SCUBE2Q9NQ36 999 aa28.16■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 MMP17Q9ULZ9 603 aa28.16■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa28.16■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 HOXB2P14652 356 aa28.16■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 ETS1P14921 441 aa28.16■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 NFKB1P19838 968 aa28.16■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 CR2P20023 1033 aa28.16■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 CD68P34810 354 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 PTGIRP43119 386 aa28.16■■■□□ 2.1
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GIPC1-201ENST00000345425 AP1S1P61966 158 aa28.16■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 FAM182AQ5T1J6 154 aa28.16■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa28.16■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 Q6ZS52 159 aa28.16■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 SRLQ86TD4 932 aa28.16■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 MMGT1Q8N4V1 131 aa28.16■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 GLIS1Q8NBF1 620 aa28.16■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa28.16■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 SEMA3CQ99985 751 aa28.16■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 ADAM23O75077 832 aa28.15■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
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GIPC1-201ENST00000345425 C9orf64Q5T6V5 341 aa28.15■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 MTG2Q9H4K7 406 aa28.15■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 NEU2Q9Y3R4 380 aa28.15■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 INSIG1O15503 277 aa28.14■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 SIN3BO75182 1162 aa28.14■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 POP4O95707 220 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa28.14■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 GRM3Q14832 879 aa28.14■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 PARP6Q2NL67 630 aa28.14■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 MYLK3Q32MK0 819 aa28.14■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 C8orf74Q6P047 294 aa28.14■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 JAMLQ86YT9 394 aa28.14■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP28.14■■■□□ 2.1
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GIPC1-201ENST00000345425 FCRL5Q96RD9 977 aa28.14■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 PRSS16Q9NQE7 514 aa28.14■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 CKAP5Q14008 2032 aa28.14■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 FAM187AA6NFU0 413 aa28.14■■■□□ 2.09
GIPC1-201ENST00000345425 ALOX15BO15296 676 aa28.14■■■□□ 2.09
GIPC1-201ENST00000345425 TTI1O43156 1089 aa28.14■■■□□ 2.09
GIPC1-201ENST00000345425 RPL22P35268 128 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.09
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GIPC1-201ENST00000345425 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.09
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GIPC1-201ENST00000345425 PRPSAP1Q14558 356 aa28.14■■■□□ 2.09
GIPC1-201ENST00000345425 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.09
GIPC1-201ENST00000345425 PRUNE1Q86TP1 453 aa28.14■■■□□ 2.09
GIPC1-201ENST00000345425 ARRDC2Q8TBH0 407 aa28.14■■■□□ 2.09
GIPC1-201ENST00000345425 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.09
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GIPC1-201ENST00000345425 CHRDQ9H2X0 955 aa28.14■■■□□ 2.09
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GIPC1-201ENST00000345425 TMEM221A6NGB7 291 aa28.13■■■□□ 2.09
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GIPC1-201ENST00000345425 SERPINF2P08697 491 aa28.13■■■□□ 2.09
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GIPC1-201ENST00000345425 IER2Q9BTL4 223 aa28.13■■■□□ 2.09
GIPC1-201ENST00000345425 NOD2Q9HC29 1040 aa28.13■■■□□ 2.09
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GIPC1-201ENST00000345425 OR6K2Q8NGY2 324 aa28.12■■■□□ 2.09
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GIPC1-201ENST00000345425 TECTAO75443 2155 aa28.12■■■□□ 2.09
GIPC1-201ENST00000345425 GOLGA6CA6NDK9 693 aa28.11■■■□□ 2.09
GIPC1-201ENST00000345425 GOLGA6BA6NDN3 693 aa28.11■■■□□ 2.09
GIPC1-201ENST00000345425 ANXA9O76027 345 aa28.11■■■□□ 2.09
GIPC1-201ENST00000345425 GOLGA6DP0CG33 693 aa28.11■■■□□ 2.09
GIPC1-201ENST00000345425 SLC14A2Q15849 920 aa28.11■■■□□ 2.09
GIPC1-201ENST00000345425 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
GIPC1-201ENST00000345425 PKN3Q6P5Z2 889 aa28.11■■■□□ 2.09
GIPC1-201ENST00000345425 NCEH1Q6PIU2 408 aa28.11■■■□□ 2.09
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