RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332029.2

SOCS1-201, Transcript of suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOCS1, Length 1,225 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1-201ENST00000332029 NCAPHQ15003 741 aa21.49■■□□□ 1.03
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SOCS1-201ENST00000332029 MANEALQ5VSG8 457 aa21.49■■□□□ 1.03
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SOCS1-201ENST00000332029 IFT43Q96FT9 208 aa21.49■■□□□ 1.03
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SOCS1-201ENST00000332029 CEP44Q9C0F1 390 aa21.49■■□□□ 1.03
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SOCS1-201ENST00000332029 A6NNZ2 444 aa21.48■■□□□ 1.03
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SOCS1-201ENST00000332029 FAM72DQ6L9T8 149 aa21.48■■□□□ 1.03
SOCS1-201ENST00000332029 Q6ZSR6 202 aa21.48■■□□□ 1.03
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SOCS1-201ENST00000332029 C3orf20Q8ND61 904 aa21.48■■□□□ 1.03
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SOCS1-201ENST00000332029 ACVRL1P37023 503 aa21.47■■□□□ 1.03
SOCS1-201ENST00000332029 ETFBP38117 255 aa21.47■■□□□ 1.03
SOCS1-201ENST00000332029 MAPKAPK2P49137 400 aa21.47■■□□□ 1.03
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SOCS1-201ENST00000332029 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF542PQ5EBM4 170 aa21.47■■□□□ 1.03
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SOCS1-201ENST00000332029 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa21.47■■□□□ 1.03
SOCS1-201ENST00000332029 WDR59Q6PJI9 974 aa21.47■■□□□ 1.03
SOCS1-201ENST00000332029 NLRP14Q86W24 1093 aa21.47■■□□□ 1.03
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SOCS1-201ENST00000332029 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
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SOCS1-201ENST00000332029 NEMP2A6NFY4 417 aa21.46■■□□□ 1.03
SOCS1-201ENST00000332029 SIGLEC16A6NMB1 481 aa21.46■■□□□ 1.03
SOCS1-201ENST00000332029 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
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SOCS1-201ENST00000332029 LRIG2O94898 1065 aa21.46■■□□□ 1.03
SOCS1-201ENST00000332029 CD160O95971 181 aa21.46■■□□□ 1.03
SOCS1-201ENST00000332029 PRB1P04280 392 aa21.46■■□□□ 1.03
SOCS1-201ENST00000332029 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
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SOCS1-201ENST00000332029 FGL2Q14314 439 aa21.46■■□□□ 1.03
SOCS1-201ENST00000332029 CDCP2Q5VXM1 449 aa21.46■■□□□ 1.03
SOCS1-201ENST00000332029 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
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SOCS1-201ENST00000332029 SLC39A7Q92504 469 aa21.46■■□□□ 1.03
SOCS1-201ENST00000332029 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
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SOCS1-201ENST00000332029 TBC1D31Q96DN5 1066 aa21.46■■□□□ 1.03
SOCS1-201ENST00000332029 FEM1CQ96JP0 617 aa21.46■■□□□ 1.03
SOCS1-201ENST00000332029 BMFQ96LC9 184 aa21.46■■□□□ 1.03
SOCS1-201ENST00000332029 FUCA2Q9BTY2 467 aa21.46■■□□□ 1.03
SOCS1-201ENST00000332029 SLC17A9Q9BYT1 436 aa21.46■■□□□ 1.03
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SOCS1-201ENST00000332029 FADS3Q9Y5Q0 445 aa21.46■■□□□ 1.03
SOCS1-201ENST00000332029 ACTL7AQ9Y615 435 aa21.46■■□□□ 1.03
SOCS1-201ENST00000332029 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa21.45■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa21.45■■□□□ 1.02
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SOCS1-201ENST00000332029 MYF5P13349 255 aa21.45■■□□□ 1.02
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SOCS1-201ENST00000332029 TYRO3Q06418 890 aa21.45■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 AOPEPQ8N6M6 819 aa21.45■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 FAM181AQ8N9Y4 354 aa21.45■■□□□ 1.02
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