RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 FAM118BQ9BPY3 351 aa13.43□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 HEPHQ9BQS7 1158 aa13.43□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 HAUS2Q9NVX0 235 aa13.43□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP13.43□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 SCML1Q9UN30 329 aa13.43□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa13.43□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 SAR1BQ9Y6B6 198 aa13.43□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 CEP192Q8TEP8 1941 aa13.42□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa13.42□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 LIASO43766 372 aa13.42□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 POP4O95707 220 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 ADH1BP00325 375 aa13.42□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 JCHAINP01591 159 aa13.42□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 HLA-DQB2P05538 268 aa13.42□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 CTSLP07711 333 aa13.42□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 PTPN3P26045 913 aa13.42□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 RBL1P28749 1068 aa13.42□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 MAPK8P45983 427 aa13.42□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 AP1S1P61966 158 aa13.42□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 RAD51Q06609 339 aa13.42□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 WASHC5Q12768 1159 aa13.42□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 GRM3Q14832 879 aa13.42□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 OASLQ15646 514 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 CST6Q15828 149 aa13.42□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 CCNG2Q16589 344 aa13.42□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 MYLK3Q32MK0 819 aa13.42□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 TEX44Q53QW1 395 aa13.42□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 TSSK4Q6SA08 328 aa13.42□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 CNTD1Q8N815 330 aa13.42□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 ERLEC1Q96DZ1 483 aa13.42□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 SIPA1Q96FS4 1042 aa13.42□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 MS4A14Q96JA4 679 aa13.42□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 NUDCD1Q96RS6 583 aa13.42□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 PRRX2Q99811 253 aa13.42□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 NT5MQ9NPB1 228 aa13.42□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 HOMER3Q9NSC5 361 aa13.42□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 IL36AQ9UHA7 158 aa13.42□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 DNPEPQ9ULA0 475 aa13.42□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 CFAP69A5D8W1 941 aa13.41□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 AXIN1O15169 862 aa13.41□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF185O15231 689 aa13.41□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 LEFTY1O75610 366 aa13.41□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 IGLV3-19P01714 112 aa13.41□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 C5AR1P21730 350 aa13.41□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 CES1P23141 567 aa13.41□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 CASQ1P31415 396 aa13.41□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 NRLP54845 237 aa13.41□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 MAXP61244 160 aa13.41□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 FAM46CQ5VWP2 391 aa13.41□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa13.41□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 SRLQ86TD4 932 aa13.41□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 WDR5BQ86VZ2 330 aa13.41□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 CREG2Q8IUH2 290 aa13.41□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 OR6K2Q8NGY2 324 aa13.41□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa13.41□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 ATG4AQ8WYN0 398 aa13.41□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 FAM131CQ96AQ9 280 aa13.41□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 TEKT5Q96M29 485 aa13.41□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa13.41□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 FERMT1Q9BQL6 677 aa13.41□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa13.41□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 SLC6A17Q9H1V8 727 aa13.41□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa13.41□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 USP29Q9HBJ7 922 aa13.41□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP13.41□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 RNF14Q9UBS8 474 aa13.41□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 SARDHQ9UL12 918 aa13.41□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 RNF103O00237 685 aa13.4□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 KRIT1O00522 736 aa13.4□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 MID1O15344 667 aa13.4□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 INSIG1O15503 277 aa13.4□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF217O75362 1048 aa13.4□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 NEBLO76041 1014 aa13.4□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 IL1BP01584 269 aa13.4□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 DNTTP04053 509 aa13.4□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 SP9P0CG40 484 aa13.4□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 SLC8A1P32418 973 aa13.4□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 PSMD8P48556 350 aa13.4□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 SCNN1BP51168 640 aa13.4□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 DMWDQ09019 674 aa13.4□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 CYP1B1Q16678 543 aa13.4□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 ARSIQ5FYB1 569 aa13.4□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 NCEH1Q6PIU2 408 aa13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms