RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000290417.6

GFRA4-201, Transcript of GDNF family receptor alpha 4, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GFRA4, Length 1,427 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4-201ENST00000290417 MYLK3Q32MK0 819 aa22.99■■□□□ 1.27
GFRA4-201ENST00000290417 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa22.99■■□□□ 1.27
GFRA4-201ENST00000290417 STPG1Q5TH74 334 aa22.99■■□□□ 1.27
GFRA4-201ENST00000290417 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa22.99■■□□□ 1.27
GFRA4-201ENST00000290417 IMPACTQ9P2X3 320 aa22.99■■□□□ 1.27
GFRA4-201ENST00000290417 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa22.99■■□□□ 1.27
GFRA4-201ENST00000290417 SHROOM3Q8TF72 1996 aa22.98■■□□□ 1.27
GFRA4-201ENST00000290417 PCDH15Q96QU1 1955 aa22.98■■□□□ 1.27
GFRA4-201ENST00000290417 CEP250Q9BV73 2442 aa22.98■■□□□ 1.27
GFRA4-201ENST00000290417 POP4O95707 220 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
GFRA4-201ENST00000290417 CD27P26842 260 aa22.98■■□□□ 1.27
GFRA4-201ENST00000290417 SERPINB6P35237 376 aa22.98■■□□□ 1.27
GFRA4-201ENST00000290417 PDK2Q15119 407 aa22.98■■□□□ 1.27
GFRA4-201ENST00000290417 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
GFRA4-201ENST00000290417 MAP7D3Q8IWC1 876 aa22.98■■□□□ 1.27
GFRA4-201ENST00000290417 EXOC2Q96KP1 924 aa22.98■■□□□ 1.27
GFRA4-201ENST00000290417 KDM4CQ9H3R0 1056 aa22.98■■□□□ 1.27
GFRA4-201ENST00000290417 LHX3Q9UBR4 397 aa22.98■■□□□ 1.27
GFRA4-201ENST00000290417 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
GFRA4-201ENST00000290417 PALMO75781 387 aa22.97■■□□□ 1.27
GFRA4-201ENST00000290417 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
GFRA4-201ENST00000290417 ITGB7P26010 798 aa22.97■■□□□ 1.27
GFRA4-201ENST00000290417 MAPK8P45983 427 aa22.97■■□□□ 1.27
GFRA4-201ENST00000290417 LIMK1P53667 647 aa22.97■■□□□ 1.27
GFRA4-201ENST00000290417 PPP2CBP62714 309 aa22.97■■□□□ 1.27
GFRA4-201ENST00000290417 PPP2CAP67775 309 aa22.97■■□□□ 1.27
GFRA4-201ENST00000290417 RAD51Q06609 339 aa22.97■■□□□ 1.27
GFRA4-201ENST00000290417 RAD9BQ6WBX8 426 aa22.97■■□□□ 1.27
GFRA4-201ENST00000290417 C1orf216Q8TAB5 229 aa22.97■■□□□ 1.27
GFRA4-201ENST00000290417 LRIG1Q96JA1 1093 aa22.97■■□□□ 1.27
GFRA4-201ENST00000290417 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
GFRA4-201ENST00000290417 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
GFRA4-201ENST00000290417 HDAC8Q9BY41 377 aa22.97■■□□□ 1.27
GFRA4-201ENST00000290417 TMEM9BQ9NQ34 198 aa22.97■■□□□ 1.27
GFRA4-201ENST00000290417 DLL3Q9NYJ7 618 aa22.97■■□□□ 1.27
GFRA4-201ENST00000290417 HYOU1Q9Y4L1 999 aa22.97■■□□□ 1.27
GFRA4-201ENST00000290417 SLC30A4O14863 429 aa22.96■■□□□ 1.27
GFRA4-201ENST00000290417 UGT2B4P06133 528 aa22.96■■□□□ 1.27
GFRA4-201ENST00000290417 SYPP08247 313 aa22.96■■□□□ 1.27
GFRA4-201ENST00000290417 TNNT1P13805 278 aa22.96■■□□□ 1.27
GFRA4-201ENST00000290417 CCR5P51681 352 aa22.96■■□□□ 1.27
GFRA4-201ENST00000290417 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
GFRA4-201ENST00000290417 TAS2R38P59533 333 aa22.96■■□□□ 1.27
GFRA4-201ENST00000290417 IL10RBQ08334 325 aa22.96■■□□□ 1.27
GFRA4-201ENST00000290417 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP22.96■■□□□ 1.27
GFRA4-201ENST00000290417 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa22.96■■□□□ 1.27
GFRA4-201ENST00000290417 RAPGEF5Q92565 580 aa22.96■■□□□ 1.27
GFRA4-201ENST00000290417 ZNF670Q9BS34 389 aa22.96■■□□□ 1.27
GFRA4-201ENST00000290417 TM9SF3Q9HD45 589 aa22.96■■□□□ 1.27
GFRA4-201ENST00000290417 DOCK9Q9BZ29 2069 aa22.96■■□□□ 1.27
GFRA4-201ENST00000290417 A0A1W2PPC4 97 aa22.95■■□□□ 1.26
GFRA4-201ENST00000290417 C4orf47A7E2U8 309 aa22.95■■□□□ 1.26
GFRA4-201ENST00000290417 ARHGAP33O14559 1287 aa22.95■■□□□ 1.26
GFRA4-201ENST00000290417 KDELR1P24390 212 aa22.95■■□□□ 1.26
GFRA4-201ENST00000290417 SLC1A1P43005 524 aa22.95■■□□□ 1.26
GFRA4-201ENST00000290417 NEK3P51956 506 aa22.95■■□□□ 1.26
GFRA4-201ENST00000290417 FBXL19Q6PCT2 694 aa22.95■■□□□ 1.26
GFRA4-201ENST00000290417 PCDH19Q8TAB3 1148 aa22.95■■□□□ 1.26
GFRA4-201ENST00000290417 KLHL32Q96NJ5 620 aa22.95■■□□□ 1.26
GFRA4-201ENST00000290417 ORAI3Q9BRQ5 295 aa22.95■■□□□ 1.26
GFRA4-201ENST00000290417 RTKNQ9BST9 563 aa22.95■■□□□ 1.26
GFRA4-201ENST00000290417 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
GFRA4-201ENST00000290417 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa22.95■■□□□ 1.26
GFRA4-201ENST00000290417 EBF2Q9HAK2 575 aa22.95■■□□□ 1.26
GFRA4-201ENST00000290417 ANKRD36A6QL64 1941 aa22.95■■□□□ 1.26
GFRA4-201ENST00000290417 DCHS1Q96JQ0 3298 aa22.94■■□□□ 1.26
GFRA4-201ENST00000290417 LRRD1A4D1F6 860 aa22.94■■□□□ 1.26
GFRA4-201ENST00000290417 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa22.94■■□□□ 1.26
GFRA4-201ENST00000290417 C10orf142B7Z368 130 aa22.94■■□□□ 1.26
GFRA4-201ENST00000290417 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
GFRA4-201ENST00000290417 INSIG1O15503 277 aa22.94■■□□□ 1.26
GFRA4-201ENST00000290417 SPOPO43791 374 aa22.94■■□□□ 1.26
GFRA4-201ENST00000290417 ADRB3P13945 408 aa22.94■■□□□ 1.26
GFRA4-201ENST00000290417 COMTP21964 271 aa22.94■■□□□ 1.26
GFRA4-201ENST00000290417 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
GFRA4-201ENST00000290417 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
GFRA4-201ENST00000290417 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
GFRA4-201ENST00000290417 HADHBP55084 474 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
GFRA4-201ENST00000290417 ZNF805Q5CZA5 627 aa22.94■■□□□ 1.26
GFRA4-201ENST00000290417 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa22.94■■□□□ 1.26
GFRA4-201ENST00000290417 GDPD4Q6W3E5 623 aa22.94■■□□□ 1.26
GFRA4-201ENST00000290417 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
GFRA4-201ENST00000290417 ATPAF2Q8N5M1 289 aa22.94■■□□□ 1.26
GFRA4-201ENST00000290417 PREBQ9HCU5 417 aa22.94■■□□□ 1.26
GFRA4-201ENST00000290417 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
GFRA4-201ENST00000290417 C16orf96A6NNT2 1141 aa22.93■■□□□ 1.26
GFRA4-201ENST00000290417 MFSD11O43934 449 aa22.93■■□□□ 1.26
GFRA4-201ENST00000290417 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
GFRA4-201ENST00000290417 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
GFRA4-201ENST00000290417 GRIK2Q13002 908 aa22.93■■□□□ 1.26
GFRA4-201ENST00000290417 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
GFRA4-201ENST00000290417 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
GFRA4-201ENST00000290417 RHOT1Q8IXI2 618 aa22.93■■□□□ 1.26
GFRA4-201ENST00000290417 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
GFRA4-201ENST00000290417 ACRBPQ8NEB7 543 aa22.93■■□□□ 1.26
GFRA4-201ENST00000290417 VOPP1Q96AW1 172 aa22.93■■□□□ 1.26
GFRA4-201ENST00000290417 FAF2Q96CS3 445 aa22.93■■□□□ 1.26
GFRA4-201ENST00000290417 SLC6A18Q96N87 628 aa22.93■■□□□ 1.26
GFRA4-201ENST00000290417 GOLPH3Q9H4A6 298 aa22.93■■□□□ 1.26
GFRA4-201ENST00000290417 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58 ms