RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281171.8

PTPRO-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,301 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-201ENST00000281171 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 UGT3A1Q6NUS8 523 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 SPIRE2Q8WWL2 714 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 RIOX1Q9H6W3 641 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 GMIPQ9P107 970 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 C17orf102A2RUQ5 167 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 OR14I1A6ND48 311 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 EML1O00423 815 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 HERC6Q8IVU3 1022 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 MRIQ9BWK5 157 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 CD274Q9NZQ7 290 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 DFFAO00273 331 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 MSH4O15457 936 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 CLPXO76031 633 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 KDM4BO94953 1096 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 CUL2Q13617 745 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 SQLEQ14534 574 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 S100PBPQ96BU1 408 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 MSANTD3Q96H12 275 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 AIFM2Q9BRQ8 373 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 KBTBD4Q9NVX7 518 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 FUOMA2VDF0 154 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 MGAT5Q09328 741 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 ANKDD1AQ495B1 522 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 RCN3Q96D15 328 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 CEP295NLQ96MC4 621 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 CGRRF1Q99675 332 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 TMEM121Q9BTD3 319 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 SLC22A4Q9H015 551 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 SIK2Q9H0K1 926 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 DPP3Q9NY33 737 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 A0A0G2JLW4 131 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 ITM2AO43736 263 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 MYCP01106 439 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 PTGER2P43116 358 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 BACE1P56817 501 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 POU4F1Q01851 419 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 MEIOBQ8N635 442 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 HPDLQ96IR7 371 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 NDFIP2Q9NV92 336 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 DPP7Q9UHL4 492 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 PSME2Q9UL46 239 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 BNIP3LO60238 219 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 ACOT2P49753 483 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 NEK3P51956 506 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 OCLNQ16625 522 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 SNAP47Q5SQN1 464 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 MPZL3Q6UWV2 235 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 TMEM246Q9BRR3 403 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 TMEM138Q9NPI0 162 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 DCDC2CA8MYV0 355 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 PGK2P07205 417 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 GEMP55040 296 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 NAB1Q13506 487 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 ALFQ53S48 1182 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 IZUMO1Q8IYV9 350 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 DEPDC4Q8N2C3 294 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 SLC7A14Q8TBB6 771 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 CXCL11O14625 94 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 NDUFS2O75306 463 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 VPS4BO75351 444 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 GLRBP48167 497 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 THOP1P52888 689 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 C16orf46Q6P387 395 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 CYP4Z1Q86W10 505 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 IL25Q9H293 177 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 DNAJC18Q9H819 358 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 LRRC40Q9H9A6 602 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 PLK4O00444 970 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 NDUFS3O75489 264 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 PROSCO94903 275 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 GRTP1Q5TC63 336 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 AFTPHQ6ULP2 937 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 PJA1Q8NG27 643 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms